185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0204 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
186 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.27 
 
 
185 aa  184  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.63 
 
 
191 aa  174  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.27 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4615  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.39 
 
 
193 aa  171  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0230  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  52.75 
 
 
184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28040  dihydrofolate reductase  53.3 
 
 
183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.160923  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  47.03 
 
 
187 aa  160  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.51 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  42.02 
 
 
199 aa  132  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  41.85 
 
 
188 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  41.85 
 
 
188 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  41.85 
 
 
188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.36 
 
 
188 aa  124  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.76 
 
 
187 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  37.97 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.87 
 
 
188 aa  96.3  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.64 
 
 
190 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  33.16 
 
 
177 aa  92  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  39.13 
 
 
190 aa  91.3  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.64 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.28 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  34.76 
 
 
189 aa  87.8  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.24 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  36.76 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.71 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.32 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.58 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.61 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.07 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.57 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  32.65 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.92 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  27.75 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.11 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.43 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  35.42 
 
 
183 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.7 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  30.98 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.9 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  32.98 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  26.49 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  29.31 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  36.98 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.18 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  30.77 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.42 
 
 
196 aa  67  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  31.02 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.77 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  33.67 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  29.94 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.11 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.75 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.84 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  32.28 
 
 
167 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.22 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  30.65 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  32.77 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.65 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  29.55 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.96 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  31.02 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  31.15 
 
 
192 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.89 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.53 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.63 
 
 
212 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.94 
 
 
188 aa  58.2  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.6 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  30.05 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3984  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.5 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.61 
 
 
184 aa  55.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.07 
 
 
199 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
177 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  32.45 
 
 
199 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  30.06 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  25.93 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.23 
 
 
187 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  31.41 
 
 
185 aa  55.1  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.84 
 
 
185 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.72 
 
 
204 aa  54.7  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  28.16 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2397  dihydrofolate reductase  28.07 
 
 
116 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.94 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  27.5 
 
 
199 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.43 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.13 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.6 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  34.84 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  26.6 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  30.23 
 
 
199 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1772  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.47 
 
 
209 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  30.37 
 
 
194 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>