243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3158 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
188 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  62.77 
 
 
187 aa  226  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  59.57 
 
 
190 aa  208  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.46 
 
 
186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  41.18 
 
 
190 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.27 
 
 
187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.74 
 
 
187 aa  127  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.74 
 
 
187 aa  127  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.83 
 
 
188 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  38.83 
 
 
188 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  37.06 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  38.3 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.33 
 
 
187 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  40.54 
 
 
187 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.17 
 
 
199 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  36.46 
 
 
199 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.92 
 
 
190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  37.84 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  37.43 
 
 
178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.04 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.83 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.59 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.87 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.9 
 
 
191 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  38.07 
 
 
176 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.73 
 
 
192 aa  103  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  39.87 
 
 
176 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  35.48 
 
 
189 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28040  dihydrofolate reductase  36.41 
 
 
183 aa  102  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.160923  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.41 
 
 
188 aa  99  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0230  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.7 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  36.71 
 
 
177 aa  94.7  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.11 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.44 
 
 
176 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.95 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  40.94 
 
 
182 aa  92  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4615  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.22 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.26 
 
 
180 aa  89  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
186 aa  87.8  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  29.69 
 
 
182 aa  87.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
194 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.26 
 
 
183 aa  85.5  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.55 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  31.69 
 
 
182 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.69 
 
 
182 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
188 aa  84.3  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  29.26 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.15 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  29.84 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.02 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.69 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.32 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.53 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  31.09 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.55 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  29.1 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.49 
 
 
181 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  30.27 
 
 
200 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  30.43 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.31 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.83 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  27.87 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.69 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  30.32 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.42 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  30.67 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.88 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.62 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  31.5 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  32.64 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.18 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  32.65 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.8 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  29.56 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.32 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.65 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  27.45 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.09 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  28.34 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  30.89 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  31.79 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  26.98 
 
 
176 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.31 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  28.71 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.57 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  27.37 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.1 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.74 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2397  dihydrofolate reductase  33.93 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  30.49 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.74 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.32 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.72 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.5 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.06 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>