192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4298 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
186 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  82.16 
 
 
194 aa  319  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  82.07 
 
 
185 aa  320  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  76.76 
 
 
185 aa  311  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3672  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  81.88 
 
 
151 aa  256  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  62.3 
 
 
182 aa  238  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  60.11 
 
 
182 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  60.77 
 
 
200 aa  227  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.56 
 
 
182 aa  223  8e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  44.62 
 
 
188 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  42.47 
 
 
188 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.57 
 
 
183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.85 
 
 
181 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.44 
 
 
183 aa  121  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  40.88 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  32.57 
 
 
177 aa  101  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.33 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.61 
 
 
183 aa  98.2  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  33.7 
 
 
179 aa  98.2  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.29 
 
 
181 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  30.11 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 
199 aa  91.7  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35 
 
 
188 aa  90.1  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.77 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.58 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.41 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  29.41 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  29.41 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.34 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.24 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.36 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.84 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  31.44 
 
 
204 aa  77.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.55 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  35.1 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  30.41 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  30.11 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  31.33 
 
 
190 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  32.1 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.22 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.7 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.53 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.66 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.96 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.97 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  27.22 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  32.72 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.23 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.84 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  28.11 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  29.28 
 
 
176 aa  72  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  29.89 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.13 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  31.77 
 
 
221 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.82 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  31.32 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.09 
 
 
221 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  29.63 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  30.48 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.8 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.31 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  28.34 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  29.83 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.47 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.59 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  28.57 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  30.67 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  30.22 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  29.84 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.19 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.78 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  30.91 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.27 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  30.39 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.32 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.02 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.86 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.95 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.67 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  26.2 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.93 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.39 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.87 
 
 
190 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.17 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  32.43 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  27.8 
 
 
217 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.73 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.19 
 
 
212 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.66 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>