260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0446 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
192 aa  383  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  61.26 
 
 
181 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  61.38 
 
 
178 aa  242  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  57.29 
 
 
183 aa  207  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.12 
 
 
182 aa  167  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  44.39 
 
 
203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  47.62 
 
 
179 aa  158  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  44.56 
 
 
199 aa  154  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  39.68 
 
 
181 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.21 
 
 
181 aa  142  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.73 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.22 
 
 
180 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  37.57 
 
 
181 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.1 
 
 
183 aa  135  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.38 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  39.58 
 
 
187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  39.47 
 
 
183 aa  131  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  45.24 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.75 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  40.86 
 
 
178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  42.41 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  49.34 
 
 
180 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  39.22 
 
 
200 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  40.1 
 
 
178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  36.45 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.21 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  42.77 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  40.96 
 
 
204 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  43.51 
 
 
178 aa  124  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.79 
 
 
219 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.41 
 
 
212 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  41.18 
 
 
215 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  40.24 
 
 
198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.28 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.55 
 
 
187 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.41 
 
 
187 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.32 
 
 
221 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.48 
 
 
204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.92 
 
 
185 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.97 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.11 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.66 
 
 
217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  41.1 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.59 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.76 
 
 
221 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  40.12 
 
 
221 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  37.28 
 
 
219 aa  114  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.72 
 
 
221 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  40.61 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.3 
 
 
178 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.58 
 
 
185 aa  111  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.51 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  47.37 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  40 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  36.95 
 
 
218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.76 
 
 
224 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.37 
 
 
177 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  41.98 
 
 
217 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  41.98 
 
 
217 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  35.15 
 
 
200 aa  105  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  36.06 
 
 
208 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  40.13 
 
 
183 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 
210 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  34.15 
 
 
199 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  41.36 
 
 
217 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42 
 
 
181 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.76 
 
 
176 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.92 
 
 
197 aa  101  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  37.93 
 
 
203 aa  101  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.98 
 
 
180 aa  101  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34 
 
 
199 aa  101  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0509  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.68 
 
 
201 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  42.07 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.84 
 
 
204 aa  99.8  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.65 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  38.16 
 
 
213 aa  99.4  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.63 
 
 
189 aa  98.2  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.12 
 
 
208 aa  97.1  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  28.72 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 
178 aa  96.7  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  38.73 
 
 
205 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.65 
 
 
204 aa  95.5  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.49 
 
 
190 aa  95.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.65 
 
 
200 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  38.89 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.25 
 
 
209 aa  92.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.36 
 
 
189 aa  92  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.51 
 
 
209 aa  92  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.2 
 
 
194 aa  91.7  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  33.14 
 
 
177 aa  90.5  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  33.95 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.31 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.03 
 
 
190 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  32.12 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  36.63 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  35.03 
 
 
208 aa  85.5  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.65 
 
 
202 aa  85.5  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38 
 
 
221 aa  85.1  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  28.57 
 
 
181 aa  84.7  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.31 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>