231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7653 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
187 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  61.2 
 
 
199 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  59.36 
 
 
203 aa  206  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.57 
 
 
204 aa  155  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  43.72 
 
 
178 aa  148  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.92 
 
 
182 aa  148  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  43.72 
 
 
183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  40.66 
 
 
181 aa  137  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0509  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.63 
 
 
201 aa  134  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.41 
 
 
192 aa  132  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.64 
 
 
183 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.07 
 
 
188 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.22 
 
 
179 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  40.21 
 
 
187 aa  114  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.57 
 
 
183 aa  108  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  33.83 
 
 
228 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  36.96 
 
 
183 aa  98.2  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.6 
 
 
212 aa  95.9  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.62 
 
 
180 aa  94.4  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.65 
 
 
194 aa  94  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.78 
 
 
180 aa  94  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.58 
 
 
219 aa  93.6  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
181 aa  92  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.2 
 
 
201 aa  92  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  35.25 
 
 
185 aa  91.7  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
177 aa  90.9  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.31 
 
 
157 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.65 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.02 
 
 
181 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.44 
 
 
217 aa  89.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.6 
 
 
187 aa  88.6  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  37.65 
 
 
214 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  37.04 
 
 
217 aa  87.8  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  37.04 
 
 
217 aa  87.8  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.02 
 
 
181 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  36.42 
 
 
217 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.14 
 
 
199 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.27 
 
 
209 aa  85.9  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  33.73 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
221 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  33.83 
 
 
221 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  33.14 
 
 
178 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  31.22 
 
 
219 aa  85.5  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  40 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.17 
 
 
210 aa  84.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.41 
 
 
204 aa  84.3  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.37 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.44 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  37.59 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.18 
 
 
189 aa  82  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.91 
 
 
187 aa  82  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.15 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  30.05 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.88 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  31.44 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.15 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.92 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.77 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.83 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  29.83 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.47 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.47 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.84 
 
 
200 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.3 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.04 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  33.95 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.09 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  33.87 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  31.55 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  30.6 
 
 
218 aa  77  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.64 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  32.64 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  27.55 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  34.71 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.72 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.45 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.61 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.38 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.62 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.76 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.03 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  27.97 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.75 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.86 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  34.18 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  32.64 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  32.14 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  32.24 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.19 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.53 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  28.89 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.22 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  30.05 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  36.84 
 
 
215 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>