238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5175 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
219 aa  453  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.07 
 
 
217 aa  223  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  44.25 
 
 
228 aa  208  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  47 
 
 
219 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.92 
 
 
221 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  47 
 
 
218 aa  196  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  46.5 
 
 
198 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  46.23 
 
 
199 aa  176  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  42.2 
 
 
221 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  46.57 
 
 
205 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.56 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.83 
 
 
201 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.32 
 
 
204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  43.72 
 
 
200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  44.62 
 
 
205 aa  161  8.000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.01 
 
 
210 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.78 
 
 
204 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  42.7 
 
 
215 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.64 
 
 
221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  44.57 
 
 
204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  42.11 
 
 
203 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  40.1 
 
 
221 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.1 
 
 
221 aa  151  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  41.12 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  41.97 
 
 
214 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.37 
 
 
200 aa  142  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.22 
 
 
204 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  39.46 
 
 
208 aa  141  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  38.69 
 
 
208 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.53 
 
 
201 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.22 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  40.22 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  40.22 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.42 
 
 
196 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.17 
 
 
197 aa  131  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  35.75 
 
 
181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.62 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.25 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.15 
 
 
209 aa  129  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  36.65 
 
 
178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.32 
 
 
204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.5 
 
 
202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  34.72 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  36.27 
 
 
183 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3623  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.04 
 
 
192 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.22 
 
 
209 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.79 
 
 
192 aa  123  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  37.82 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  35.79 
 
 
181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.46 
 
 
180 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  33.16 
 
 
180 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.85 
 
 
182 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.46 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  34.2 
 
 
183 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.22 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.94 
 
 
179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.46 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  31.9 
 
 
199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.75 
 
 
178 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.25 
 
 
180 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.46 
 
 
203 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  34.92 
 
 
178 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  37.22 
 
 
187 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.21 
 
 
181 aa  99.4  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  34.3 
 
 
183 aa  98.6  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.65 
 
 
199 aa  98.2  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.46 
 
 
188 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.37 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.5 
 
 
183 aa  96.3  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
181 aa  95.5  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.04 
 
 
157 aa  95.9  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.86 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.24 
 
 
190 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.64 
 
 
185 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
192 aa  92  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.61 
 
 
187 aa  91.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.31 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
181 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.23 
 
 
183 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.38 
 
 
180 aa  90.9  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.5 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.09 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.16 
 
 
178 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.93 
 
 
178 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  34.81 
 
 
192 aa  88.2  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  31.73 
 
 
192 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.32 
 
 
177 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  32.79 
 
 
179 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  33.16 
 
 
183 aa  85.1  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  30.69 
 
 
178 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.58 
 
 
187 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  29.32 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.35 
 
 
204 aa  81.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.06 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.57 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.7 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  27.04 
 
 
185 aa  79  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  25 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>