192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3142 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
192 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  81.58 
 
 
192 aa  322  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  77.66 
 
 
192 aa  305  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  74.74 
 
 
189 aa  284  5.999999999999999e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.33 
 
 
190 aa  235  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  56.77 
 
 
187 aa  219  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  54.69 
 
 
208 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.2 
 
 
180 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.51 
 
 
187 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.81 
 
 
197 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.73 
 
 
179 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.42 
 
 
196 aa  96.3  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.67 
 
 
201 aa  91.7  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  34.72 
 
 
178 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.22 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.94 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.04 
 
 
201 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.54 
 
 
200 aa  88.6  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.81 
 
 
219 aa  88.2  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.41 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  29.9 
 
 
181 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  31.98 
 
 
180 aa  84.3  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.39 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.34 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  35.08 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.47 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.67 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.84 
 
 
201 aa  82  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 
185 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.31 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.16 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  31.12 
 
 
198 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  32.34 
 
 
221 aa  80.9  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.38 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  34.18 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  32.29 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.84 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.34 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.66 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  31.12 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.5 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.57 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.21 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  31.61 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  30.46 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.73 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  32.32 
 
 
208 aa  74.3  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.57 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  28.78 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  32.99 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  34.54 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  31.98 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.1 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.41 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  31.28 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.23 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.36 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.31 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.02 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  27.55 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.5 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  33.99 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.12 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  30.72 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.53 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  27.84 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  27.96 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  32.14 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  29.38 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.63 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.23 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.74 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.46 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  27.36 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  30.26 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.9 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  32.97 
 
 
208 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.47 
 
 
217 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  32.47 
 
 
217 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  32.47 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.02 
 
 
199 aa  62.8  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  26.77 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.55 
 
 
183 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.97 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  28.92 
 
 
190 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.08 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  28.42 
 
 
205 aa  62  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.27 
 
 
189 aa  62  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.25 
 
 
209 aa  61.6  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.54 
 
 
187 aa  61.6  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.43 
 
 
221 aa  61.6  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  31.22 
 
 
214 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.21 
 
 
203 aa  61.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  33.77 
 
 
184 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.56 
 
 
190 aa  61.2  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
194 aa  61.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>