170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21110 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  100 
 
 
208 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  67.82 
 
 
205 aa  271  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  59.62 
 
 
214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  58.65 
 
 
217 aa  231  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  58.65 
 
 
217 aa  231  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  58.65 
 
 
217 aa  231  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  54.81 
 
 
209 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.71 
 
 
204 aa  191  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.55 
 
 
221 aa  187  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.96 
 
 
200 aa  181  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  46.08 
 
 
204 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.6 
 
 
204 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  45.1 
 
 
215 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.66 
 
 
204 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  46.77 
 
 
221 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.92 
 
 
212 aa  148  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.33 
 
 
221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.33 
 
 
221 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  39.9 
 
 
228 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.54 
 
 
217 aa  144  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.46 
 
 
219 aa  141  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  42.27 
 
 
219 aa  141  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  43.65 
 
 
218 aa  138  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  46.28 
 
 
205 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.25 
 
 
201 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  40.44 
 
 
198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.02 
 
 
210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  41.49 
 
 
201 aa  125  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.94 
 
 
221 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.44 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  39.78 
 
 
199 aa  118  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  36.04 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.31 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.8 
 
 
197 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.21 
 
 
204 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  39.57 
 
 
208 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.51 
 
 
224 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.54 
 
 
200 aa  104  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  42.37 
 
 
203 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  35.53 
 
 
221 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  39.49 
 
 
196 aa  101  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  35.83 
 
 
213 aa  99.4  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  34.25 
 
 
181 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.72 
 
 
187 aa  94  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  35.96 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.87 
 
 
179 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  34.64 
 
 
178 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.91 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
203 aa  89  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.37 
 
 
180 aa  87.8  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  32.16 
 
 
183 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.85 
 
 
181 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.03 
 
 
192 aa  85.5  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.98 
 
 
199 aa  84.7  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.57 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3623  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.91 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.05 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  38.64 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  30.73 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.32 
 
 
182 aa  82  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.04 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  36.51 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.02 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.88 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  39.05 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  30.68 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  32.29 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.56 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  34.81 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.81 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.85 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
185 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.24 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.41 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.72 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.22 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.96 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.33 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  29.67 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.22 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.14 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.94 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.19 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.13 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.68 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.37 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.15 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.4 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  32.97 
 
 
192 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.48 
 
 
186 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.04 
 
 
185 aa  62.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.16 
 
 
188 aa  62  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.75 
 
 
188 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.79 
 
 
188 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  31.94 
 
 
192 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.63 
 
 
178 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.87 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>