240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3191 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
183 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  53.26 
 
 
180 aa  189  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  57.76 
 
 
157 aa  175  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  46.02 
 
 
178 aa  137  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.62 
 
 
182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  43.75 
 
 
183 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  43.18 
 
 
181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  41.21 
 
 
203 aa  120  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  42.86 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  44.07 
 
 
199 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.97 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  39.33 
 
 
178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.98 
 
 
180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.15 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  36.61 
 
 
181 aa  108  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.96 
 
 
178 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.4 
 
 
204 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.27 
 
 
212 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.79 
 
 
200 aa  104  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.38 
 
 
181 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  36.61 
 
 
181 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  35.03 
 
 
198 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.63 
 
 
217 aa  99.8  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.76 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.74 
 
 
196 aa  99  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.96 
 
 
186 aa  98.2  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.78 
 
 
180 aa  98.2  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  38.71 
 
 
221 aa  97.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.03 
 
 
202 aa  97.8  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  36.16 
 
 
183 aa  97.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.5 
 
 
219 aa  96.3  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.57 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.77 
 
 
210 aa  95.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.05 
 
 
209 aa  95.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.6 
 
 
221 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.5 
 
 
177 aa  94.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.84 
 
 
183 aa  94.4  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.82 
 
 
204 aa  93.6  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.62 
 
 
224 aa  93.6  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.31 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.04 
 
 
185 aa  92  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.86 
 
 
188 aa  91.3  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.04 
 
 
221 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  38.65 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  35.29 
 
 
228 aa  90.5  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  35.98 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.43 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  36.61 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.69 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  31.96 
 
 
219 aa  89  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  37.93 
 
 
187 aa  88.6  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  34.04 
 
 
204 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
204 aa  88.2  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.41 
 
 
208 aa  87.8  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  36.92 
 
 
213 aa  87.4  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  37.84 
 
 
178 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
221 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  34.04 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.55 
 
 
193 aa  85.9  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.91 
 
 
190 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  36.56 
 
 
215 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.76 
 
 
181 aa  82  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.24 
 
 
189 aa  82  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.56 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  35.05 
 
 
214 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.56 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.54 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  41.01 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.67 
 
 
200 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.35 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  36.02 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  31.28 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  40.14 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  33.16 
 
 
192 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.76 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  31.47 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.03 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.98 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.16 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.67 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  32.67 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  32.67 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.48 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.6 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  34.24 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  34.64 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.28 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.55 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.9 
 
 
188 aa  72  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.62 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.02 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  36.76 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  32.95 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  35.92 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  36.13 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  28.49 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  32.24 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  31.02 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>