206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0067 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
157 aa  323  8.000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  57.76 
 
 
183 aa  175  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52.53 
 
 
180 aa  158  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  37.18 
 
 
183 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  38.06 
 
 
199 aa  97.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  41.77 
 
 
228 aa  97.1  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.04 
 
 
219 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  38.75 
 
 
178 aa  94.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
203 aa  93.6  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  38.04 
 
 
181 aa  91.3  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.22 
 
 
204 aa  90.1  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  38.57 
 
 
178 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.12 
 
 
217 aa  86.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  36.6 
 
 
219 aa  87  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 
210 aa  85.1  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40 
 
 
179 aa  84  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  39.1 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.84 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  33.55 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.18 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.48 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.69 
 
 
201 aa  80.9  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  37.91 
 
 
218 aa  80.5  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.31 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.22 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.76 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.3 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  34 
 
 
183 aa  79  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.8 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.21 
 
 
221 aa  77.8  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.1 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  34.03 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  35.29 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.12 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  30.97 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  35.29 
 
 
203 aa  74.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.85 
 
 
181 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.51 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  34.19 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.61 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.54 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.71 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  36.84 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  32.93 
 
 
221 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  32.41 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
209 aa  71.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  36.76 
 
 
208 aa  70.9  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  38.35 
 
 
181 aa  70.9  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.26 
 
 
217 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
217 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.1 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  34.15 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.88 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  36.76 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  36.72 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.92 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.04 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.03 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  31.61 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  32.41 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.79 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.55 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.59 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  35.29 
 
 
215 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
208 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
205 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  33.82 
 
 
199 aa  67.4  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.57 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3623  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.31 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  31.75 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  31.58 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.08 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.11 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.61 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.29 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.52 
 
 
189 aa  63.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.72 
 
 
224 aa  63.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0509  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.4 
 
 
201 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.52 
 
 
183 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.58 
 
 
195 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.42 
 
 
188 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.33 
 
 
178 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.74 
 
 
194 aa  61.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.67 
 
 
187 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.33 
 
 
189 aa  60.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.59 
 
 
209 aa  60.5  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.93 
 
 
204 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.1 
 
 
188 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.35 
 
 
190 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.47 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  29.5 
 
 
183 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.04 
 
 
185 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.69 
 
 
199 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.62 
 
 
178 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.11 
 
 
188 aa  57.8  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.03 
 
 
199 aa  57.4  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.56 
 
 
188 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>