295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1347 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 185 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  51.91 
 
 		 181 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  48.89 
 
 		 180 aa  194  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.32 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.21 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.95 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.63 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.91 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.53 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  32.98 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.89 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.32 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  32.99 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  34.32 
 
 		 173 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  32.62 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  30.98 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  34.32 
 
 		 174 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  34.43 
 
 		 172 aa  92  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  31.72 
 
 		 194 aa  92  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  92  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  32.96 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  31.95 
 
 		 173 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.36 
 
 		 174 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.67 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  30.81 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  32.54 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.46 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.24 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 		 194 aa  88.6  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.11 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  31.95 
 
 		 173 aa  88.2  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  31.95 
 
 		 173 aa  88.2  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  31.95 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  30.81 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  30.18 
 
 		 173 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.56 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 		 204 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.67 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  32.09 
 
 		 199 aa  85.1  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 		 190 aa  85.1  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  29.41 
 
 		 176 aa  84.3  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  28.65 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.12 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  27.18 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  27.72 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  29.76 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.14 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  28.64 
 
 		 198 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  30.11 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.43 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  27.47 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.62 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.82 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.32 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  27.17 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  30.32 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.72 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  31.16 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  29.61 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.55 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.59 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  31.32 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  29.69 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.96 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  27.45 
 
 		 228 aa  72  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.66 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  29.79 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  28.5 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  28.49 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  26.73 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.65 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  31.79 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.49 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  29.28 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.73 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  25.95 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.04 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  28.02 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  29.35 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.86 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.06 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  27.6 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.61 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  25.41 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  28.43 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  29.05 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.72 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  27.32 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.08 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  24.08 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  25.68 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  27.08 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.72 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>