204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1572 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  100 
 
 		 175 aa  358  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52.02 
 
 		 177 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  50.3 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  49.11 
 
 		 180 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  44.71 
 
 		 192 aa  141  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.86 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.35 
 
 		 184 aa  127  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  38.24 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  34.91 
 
 		 183 aa  124  6e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  41.95 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  37.43 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  38.6 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.71 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  37.36 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  42.35 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  36.21 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  33.72 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  35.67 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  33.72 
 
 		 181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  35.67 
 
 		 173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  35.67 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  35.67 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  35.67 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  36.05 
 
 		 390 aa  111  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  35.63 
 
 		 173 aa  110  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  35.67 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  36.26 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  35.09 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  36.26 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.31 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  35.67 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.85 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.47 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  32.35 
 
 		 176 aa  107  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  38.64 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  36.87 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.16 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.94 
 
 		 175 aa  104  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  35.59 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  35.59 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  35.59 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.84 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  40.27 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.12 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  32.95 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.58 
 
 		 212 aa  99  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  39.88 
 
 		 207 aa  98.6  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  39.86 
 
 		 177 aa  95.1  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  34.44 
 
 		 196 aa  94  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 181 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.81 
 
 		 186 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  31.46 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.23 
 
 		 177 aa  90.9  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  32.54 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  32.54 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  31.46 
 
 		 178 aa  88.6  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.61 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.93 
 
 		 180 aa  87.8  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  35.16 
 
 		 186 aa  87.8  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.64 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.33 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  31.36 
 
 		 177 aa  85.1  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  34.43 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  36.31 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  32.77 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  31.05 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.97 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.11 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.97 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  36.97 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.8 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.14 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.95 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  29.95 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  27.78 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  27.87 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  28.89 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.12 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.95 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  27.81 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.54 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  26.23 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  28.8 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.55 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.05 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3113  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.65 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.49 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  27.43 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.46 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03197  dihydrofolate reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06820)  28.93 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.245608 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  29.44 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.73 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  29.23 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.27 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  28.65 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1305  dihydrofolate reductase-like protein  26.58 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>