176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2202 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 177 aa  359  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  61.71 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  53.23 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  52.63 
 
 		 177 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  52.63 
 
 		 177 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  52.05 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  49.19 
 
 		 187 aa  170  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  50.59 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.17 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  53.8 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50 
 
 		 193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.27 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  50.55 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  47.93 
 
 		 173 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  48.92 
 
 		 193 aa  158  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.19 
 
 		 181 aa  157  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.13 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  46.91 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  42.16 
 
 		 183 aa  131  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  47.03 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.24 
 
 		 183 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  33.52 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  35.2 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  34.08 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  33.15 
 
 		 173 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  33.52 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  33.52 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  34.08 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  34.08 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  34.08 
 
 		 173 aa  91.3  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.75 
 
 		 177 aa  90.9  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  40.23 
 
 		 175 aa  90.9  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.6 
 
 		 182 aa  90.9  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  35.71 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  32.76 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  36.93 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  36.31 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  36.84 
 
 		 186 aa  85.1  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.33 
 
 		 174 aa  84.3  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.55 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  32.57 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  28 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.76 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  30.81 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  28.29 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  39.07 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  30.72 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.89 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  37.95 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  31.4 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.53 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.15 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  37.8 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.43 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.26 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.18 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  34.81 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  29.79 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  32.31 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  29.56 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  26.63 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.87 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  28.9 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.9 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.44 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.62 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.07 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  31.33 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  33.56 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.2 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  30.17 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  31.41 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  27.12 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  27.12 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  25 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  29.28 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.49 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.11 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  25.71 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  29.73 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.94 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  29.73 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.25 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.2 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.73 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  29.83 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  32.28 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  29.22 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  28.73 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.03 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.03 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  29.83 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  25 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  24.39 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  24.74 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>