176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1963 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  367  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  99.45 
 
 
181 aa  364  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  59.55 
 
 
390 aa  231  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.72 
 
 
178 aa  186  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  49.43 
 
 
180 aa  174  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  46.02 
 
 
173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  49.71 
 
 
178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  46.89 
 
 
199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  46.89 
 
 
183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  46.89 
 
 
183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  46.89 
 
 
183 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.33 
 
 
183 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  43.75 
 
 
177 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  46.89 
 
 
183 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.13 
 
 
212 aa  154  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  43.43 
 
 
207 aa  150  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  42.46 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  44.94 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  42.41 
 
 
178 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.53 
 
 
181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.95 
 
 
176 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  40.45 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.64 
 
 
177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  40.78 
 
 
184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  40.33 
 
 
176 aa  127  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  39.08 
 
 
181 aa  124  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  39.1 
 
 
178 aa  123  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  38.46 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  36.46 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  42.21 
 
 
177 aa  119  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  36.16 
 
 
177 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  36.16 
 
 
177 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.27 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  36.16 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.96 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.48 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  33.72 
 
 
175 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  36.67 
 
 
183 aa  111  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03197  dihydrofolate reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06820)  37.91 
 
 
210 aa  109  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.245608 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.11 
 
 
174 aa  102  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  34.62 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  34.62 
 
 
173 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  36.11 
 
 
172 aa  97.8  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  34.66 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  34.62 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  34.62 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  34.07 
 
 
174 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  34.62 
 
 
173 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 
184 aa  95.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.11 
 
 
175 aa  95.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  34.07 
 
 
173 aa  94.4  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.71 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  29.35 
 
 
199 aa  94  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  34.07 
 
 
173 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  29.67 
 
 
192 aa  92  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  33.52 
 
 
173 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  30.9 
 
 
176 aa  88.2  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  31.87 
 
 
173 aa  87.4  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  33.52 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  28.95 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.89 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.02 
 
 
176 aa  72  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  24.72 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.49 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  24.18 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  28.72 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.1 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.26 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  27.74 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.11 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  28.72 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  30.82 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.42 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.26 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.18 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.67 
 
 
189 aa  60.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.52 
 
 
181 aa  60.8  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1685  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.8 
 
 
350 aa  60.5  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  25.87 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.03 
 
 
177 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.12 
 
 
177 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  26.23 
 
 
175 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.37 
 
 
180 aa  59.3  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.66 
 
 
177 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  29.66 
 
 
177 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.27 
 
 
179 aa  58.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1674  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.88 
 
 
386 aa  58.2  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164227  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2447  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.22 
 
 
345 aa  57.8  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3982  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.14 
 
 
341 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  26.8 
 
 
193 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1669  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.63 
 
 
373 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.04431e-16 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00060  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase /5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  22.96 
 
 
355 aa  55.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.168249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3599  5-amino-6-(5- phosphoribosylamino)uracilreductase  26.94 
 
 
319 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922872 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15710  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase /5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  25.9 
 
 
349 aa  55.1  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.82 
 
 
199 aa  54.7  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.34 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06432  dihydrofolate reductase  45.83 
 
 
75 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  23.81 
 
 
187 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1311  riboflavin biosynthesis protein RibD  25 
 
 
372 aa  53.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.885852  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  25.65 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>