127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3970 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
186 aa  383  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  55.68 
 
 
187 aa  224  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  53.01 
 
 
183 aa  194  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  53.23 
 
 
177 aa  182  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  50.55 
 
 
186 aa  170  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.8 
 
 
193 aa  162  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  46.7 
 
 
193 aa  158  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.15 
 
 
186 aa  157  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.6 
 
 
187 aa  153  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.74 
 
 
179 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  45.7 
 
 
182 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.98 
 
 
177 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  48.13 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  40.98 
 
 
177 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.44 
 
 
177 aa  131  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  38.17 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  44.03 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.68 
 
 
181 aa  122  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.8 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.93 
 
 
183 aa  117  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.46 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  29.78 
 
 
173 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  27.75 
 
 
172 aa  85.1  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.75 
 
 
177 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  28.41 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.41 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  28.41 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  28 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  28 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  28 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  28.41 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  28.41 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.59 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  27.27 
 
 
173 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  27.22 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  34.12 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.24 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.07 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  28.89 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  26.74 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  29.68 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  31.41 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  28.99 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  25 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  29.19 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.03 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.67 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  27.51 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  26.82 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  31.89 
 
 
177 aa  61.6  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.93 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.53 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  32 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  27.75 
 
 
173 aa  58.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.97 
 
 
185 aa  58.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  29.48 
 
 
177 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  29.48 
 
 
177 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  25 
 
 
180 aa  58.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  30.38 
 
 
177 aa  57.8  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.62 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.79 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.03 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.87 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  26.74 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.32 
 
 
390 aa  55.1  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  31.61 
 
 
222 aa  55.1  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  27.96 
 
 
195 aa  54.7  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.79 
 
 
181 aa  54.7  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  29.8 
 
 
213 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  25.13 
 
 
181 aa  54.7  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.46 
 
 
176 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  30 
 
 
199 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  27.07 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.9 
 
 
201 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.91 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.32 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  26.02 
 
 
181 aa  52.4  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  26.95 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  25.51 
 
 
181 aa  52  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  29.41 
 
 
195 aa  51.6  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  27.67 
 
 
177 aa  51.6  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.7 
 
 
188 aa  51.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.48 
 
 
182 aa  51.2  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  25.17 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  26.85 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.16 
 
 
213 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  29.59 
 
 
214 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  29.65 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.24 
 
 
220 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.24 
 
 
220 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.61 
 
 
180 aa  48.9  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  31.3 
 
 
219 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  27.46 
 
 
190 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  23.68 
 
 
178 aa  47.8  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  30.23 
 
 
216 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  30.23 
 
 
216 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  30.23 
 
 
216 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.99 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>