217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0449 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 		 183 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  97.27 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  96.17 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  95.63 
 
 		 183 aa  363  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  93.44 
 
 		 183 aa  358  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  51.41 
 
 		 173 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.31 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  48.86 
 
 		 390 aa  160  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  46.89 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  46.89 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.32 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.75 
 
 		 181 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  44.57 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  45.45 
 
 		 177 aa  148  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  43.18 
 
 		 178 aa  148  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  46.33 
 
 		 177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  43.75 
 
 		 177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.55 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  42.37 
 
 		 181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  44.89 
 
 		 178 aa  144  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  45.25 
 
 		 180 aa  144  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  44.57 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  44.32 
 
 		 199 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  38.55 
 
 		 175 aa  127  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  38.98 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  37.64 
 
 		 174 aa  117  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.08 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  36 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  36 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.3 
 
 		 177 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.31 
 
 		 182 aa  111  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.91 
 
 		 184 aa  111  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  36 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  37.29 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.17 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  38.17 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  32.97 
 
 		 176 aa  107  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  38.25 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  37.71 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.81 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.8 
 
 		 176 aa  104  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  35.59 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  33.71 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  33.91 
 
 		 174 aa  101  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 174 aa  100  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  34.48 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  33.91 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  35.96 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  36.63 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  33.91 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  33.91 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  32.76 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  33.91 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  33.33 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  33.33 
 
 		 173 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03197  dihydrofolate reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06820)  33.33 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.245608 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.79 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.43 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  30.9 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  31.72 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  29.1 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  30.48 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  27.84 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  30.26 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  29.84 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.03 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.79 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.43 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  32.76 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.44 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.52 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  28.57 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  27.51 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  28.89 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.96 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.59 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.87 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.34 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06432  dihydrofolate reductase  46.48 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.8 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  29.95 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  29.26 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  26.92 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.19 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.95 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  32.77 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.38 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  30.26 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.47 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3404  riboflavin biosynthesis protein RibD  26.88 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.84 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  30.67 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.88 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1674  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30.63 
 
 		 386 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164227  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.76 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>