181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0225 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  100 
 
 
177 aa  358  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
177 aa  358  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  98.87 
 
 
177 aa  354  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  75.14 
 
 
173 aa  268  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  73.1 
 
 
173 aa  265  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52.63 
 
 
177 aa  177  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  52.94 
 
 
185 aa  168  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.71 
 
 
181 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  46.02 
 
 
180 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  47.09 
 
 
182 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.57 
 
 
179 aa  137  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.2 
 
 
187 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  40.98 
 
 
186 aa  134  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  46.25 
 
 
193 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.57 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.3 
 
 
193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  44.03 
 
 
186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  44.94 
 
 
187 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.5 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  45.16 
 
 
193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  37.89 
 
 
183 aa  95.1  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.02 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  35.33 
 
 
192 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  31.21 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.6 
 
 
174 aa  85.1  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  29.07 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  36.05 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  34.64 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  28.16 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.32 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  29.48 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  30.46 
 
 
172 aa  80.9  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  28.9 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  28.9 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  28.32 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  28.32 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  36.97 
 
 
175 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  29.89 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.08 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  32.97 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  32.21 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.24 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  34.81 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  31.03 
 
 
172 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.32 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  34.08 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.17 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  29.3 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  30.67 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  30.67 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.7 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.75 
 
 
176 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  32.24 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  29.03 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  30 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.85 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  28.49 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.03 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  31.69 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  32 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.81 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  27.81 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  32.87 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  32.87 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  33.33 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  26.42 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  29.76 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  25.45 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  32.65 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  30.67 
 
 
199 aa  62.4  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.83 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.32 
 
 
176 aa  59.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.17 
 
 
390 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.22 
 
 
180 aa  58.9  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  29.66 
 
 
181 aa  58.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  30.14 
 
 
173 aa  58.2  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.27 
 
 
182 aa  57.8  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.32 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.89 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  28.19 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  27.63 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  29.22 
 
 
196 aa  55.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  34.33 
 
 
214 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  35.54 
 
 
219 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  30.95 
 
 
195 aa  55.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  29.94 
 
 
207 aa  55.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  25.75 
 
 
181 aa  54.7  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  33.9 
 
 
213 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  31.58 
 
 
184 aa  54.7  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.62 
 
 
220 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.62 
 
 
220 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.19 
 
 
188 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  29.19 
 
 
188 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  28.89 
 
 
188 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.52 
 
 
213 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  37.86 
 
 
180 aa  52  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.68 
 
 
240 aa  51.6  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>