184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3108 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 		 207 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  49.13 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  45.93 
 
 		 178 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  47.98 
 
 		 199 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  47.4 
 
 		 180 aa  168  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  46.86 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  49.71 
 
 		 173 aa  164  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  46.29 
 
 		 181 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  44.09 
 
 		 390 aa  157  9e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  45.14 
 
 		 183 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  45.2 
 
 		 183 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  45.2 
 
 		 183 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.2 
 
 		 183 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  44.07 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  41.28 
 
 		 178 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  44.68 
 
 		 196 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  37.79 
 
 		 181 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.25 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  40.35 
 
 		 178 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  41.95 
 
 		 175 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  40.35 
 
 		 177 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  35.23 
 
 		 177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  42.08 
 
 		 184 aa  121  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  35.56 
 
 		 183 aa  121  9e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.96 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  40.7 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  41.14 
 
 		 180 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.08 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  39.88 
 
 		 175 aa  115  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  39.2 
 
 		 176 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.68 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  39.18 
 
 		 177 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  39.18 
 
 		 177 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  36.99 
 
 		 177 aa  104  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  31.79 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  34.81 
 
 		 192 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.06 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.21 
 
 		 175 aa  99  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03197  dihydrofolate reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06820)  36.65 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.245608 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  31.98 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.3 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  28.74 
 
 		 172 aa  89  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.76 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.58 
 
 		 174 aa  87.8  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  30.11 
 
 		 173 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  32.42 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  31.07 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  30.51 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  31.07 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  30.51 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  28.98 
 
 		 173 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  29.71 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  29.78 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  28.98 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.41 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.3 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  34.48 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.05 
 
 		 178 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.8 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.45 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.71 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.9 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.57 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  32.07 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  31.91 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  30.34 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06432  dihydrofolate reductase  40.85 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.73 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  29.63 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  23.5 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.19 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  25.68 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  28.19 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.33 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  30.26 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.51 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.34 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.6 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  31.52 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  31.43 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.11 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.51 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  30.51 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  27.66 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  29.51 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  32.19 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.11 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.13 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  28.04 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  28.02 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.08 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.23 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.41 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>