More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1305 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1305  dihydrofolate reductase-like protein  100 
 
 		 169 aa  333  5e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1150  dihydrofolate reductase-like protein  98.82 
 
 		 169 aa  331  2e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0646  dihydrofolate reductase region  43.57 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0026  dihydrofolate reductase region  37.28 
 
 		 176 aa  110  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000208627  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1542  dihydrofolate reductase region  39.88 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.14 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  40 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  35.47 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.91 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.12 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  39.78 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1352  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  37.63 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0644907 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  27.34 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  23.67 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1610  dihydrofolate reductase region  40.23 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  23.08 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  26.58 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  21.76 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  22.56 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  29.17 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  22.56 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  29.17 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  22.56 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  28.38 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  22.56 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  28.95 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  34.17 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  34.62 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.17 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3263  dihydrofolate reductase  33.87 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.254952  normal  0.239963 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  34.95 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  39.81 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  23.57 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  31.39 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  28.74 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  26.87 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1002  dihydrofolate reductase  37.25 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64057  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  30.3 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  32.39 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  37.86 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  22.75 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82622  dihydrofolate reductase  31.45 
 
 		 203 aa  53.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.778067 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0353  dihydrofolate reductase FolA  28.26 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  21.89 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  37.14 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1515  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.46 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.17 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  37.25 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.29 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  32.69 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1486  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.471201  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  27.45 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  36.27 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  39.22 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  27.97 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  22.56 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.42 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  31.88 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2031  Dihydrofolate reductase  36.05 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00277782  hitchhiker  0.0000505034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  26.8 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  33.55 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  27.62 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2988  Dihydrofolate reductase  36.11 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.302882  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  24.72 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0378  dihydrofolate reductase FolA  33.33 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  30.63 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  40.38 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  37.14 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1581  dihydrofolate reductase  35.29 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.526666  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  30.89 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  34.35 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  30.28 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  35.92 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  26.74 
 
 		 180 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  31.1 
 
 		 199 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  31.54 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  31.21 
 
 		 187 aa  51.2  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  36.63 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.42 
 
 		 181 aa  51.2  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  33.57 
 
 		 161 aa  51.2  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  31.5 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  38.61 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_1690  predicted protein  31.06 
 
 		 495 aa  51.2  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  30.08 
 
 		 191 aa  50.8  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1685  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.88 
 
 		 350 aa  50.8  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  35.64 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  40.66 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  33.64 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  26.36 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.37 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  31.72 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  33.98 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  35.64 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  34.29 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  34.65 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  29.27 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0770  dihydrofolate reductase  32.46 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>