267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0646 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0646  dihydrofolate reductase region  100 
 
 		 162 aa  320  6e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1150  dihydrofolate reductase-like protein  44.29 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1305  dihydrofolate reductase-like protein  43.57 
 
 		 169 aa  117  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1542  dihydrofolate reductase region  41.76 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0026  dihydrofolate reductase region  40.46 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000208627  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  34.65 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  30 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  34.65 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1002  dihydrofolate reductase  36.11 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64057  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  36 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  33.66 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  30.77 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  32.26 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  32.65 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  27.48 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  30.15 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  30.65 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1610  dihydrofolate reductase region  37.38 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  34.4 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1581  dihydrofolate reductase  35.29 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.526666  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  34.13 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  35.4 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  35.4 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1486  dihydrofolate reductase  36.27 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.471201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  35.4 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  35.4 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1515  dihydrofolate reductase  36.27 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  32.65 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  37.18 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1411  Dihydrofolate reductase  38.68 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000149982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  37.18 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  32.23 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0389  dihydrofolate reductase  30.06 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  37.18 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  37.18 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  37.18 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  32.23 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  32.65 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  30.38 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  37.18 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  37.18 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  37.18 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  34.23 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0378  dihydrofolate reductase FolA  32.54 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  37.18 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  37.18 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  37.18 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  31.5 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  33.01 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  37.18 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  35.07 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0353  dihydrofolate reductase FolA  31.75 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  35.9 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  29.17 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  32.04 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  38.89 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  28.68 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  28.33 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  28.38 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  35.29 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  34.86 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  30.63 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  36.63 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  32.54 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  36.9 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  29.51 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0164  Dihydrofolate reductase  35.71 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0404291  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  37.18 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  29.7 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  33.02 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  32.08 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  32.54 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1226  dihydrofolate reductase  38.95 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00227067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  33.72 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2988  Dihydrofolate reductase  26.35 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.302882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  33.71 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  33.71 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  30 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  33.72 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0770  dihydrofolate reductase  29.45 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  33.72 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  31.36 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1626  dihydrofolate reductase region  39.36 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.337303  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  39.76 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  29.03 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  30.39 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  33.71 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  34 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  28.24 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  31.62 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  30.3 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2799  dihydrofolate reductase region  35 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2043  dihydrofolate reductase  27.52 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  36.54 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>