267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1626 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1626  dihydrofolate reductase region  100 
 
 
164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.337303  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0631  dihydrofolate reductase region  38.12 
 
 
162 aa  114  5e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  35.44 
 
 
162 aa  110  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  32.74 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  35 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1226  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 
167 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00227067  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
160 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  38.65 
 
 
169 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  33.96 
 
 
160 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  33.96 
 
 
160 aa  103  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  36.81 
 
 
167 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  34.59 
 
 
160 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  34.15 
 
 
166 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  33.95 
 
 
162 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  33.96 
 
 
160 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  33.96 
 
 
160 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  33.96 
 
 
160 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  33.75 
 
 
167 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  33.75 
 
 
167 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
160 aa  101  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  31.65 
 
 
164 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  33.96 
 
 
160 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  36.73 
 
 
166 aa  100  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  36.5 
 
 
176 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0054  dihydrofolate reductase  37.82 
 
 
161 aa  100  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1610  dihydrofolate reductase region  43.66 
 
 
155 aa  100  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  33.95 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  33.95 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  34.34 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  31.87 
 
 
163 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0051  dihydrofolate reductase  36.71 
 
 
161 aa  99.8  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  34.59 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  35 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  33.96 
 
 
160 aa  97.8  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  33.73 
 
 
171 aa  97.1  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  32.7 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  35.07 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  32.08 
 
 
160 aa  94.7  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  34.15 
 
 
165 aa  94.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  31.33 
 
 
172 aa  94.4  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  31.06 
 
 
162 aa  94.4  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  31.48 
 
 
162 aa  94.4  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  33.12 
 
 
162 aa  94.4  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  31.06 
 
 
162 aa  94.4  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  31.48 
 
 
162 aa  94  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  31.48 
 
 
162 aa  94  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  31.48 
 
 
162 aa  94  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  31.48 
 
 
162 aa  94  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  31.48 
 
 
162 aa  94  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  32.32 
 
 
166 aa  94  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  33.96 
 
 
161 aa  94  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  31.48 
 
 
162 aa  94  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  31.33 
 
 
172 aa  94  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  31.06 
 
 
162 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  36.43 
 
 
220 aa  92.8  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  32.3 
 
 
163 aa  92.8  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  30.72 
 
 
160 aa  92.4  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
160 aa  92  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  36.65 
 
 
162 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  30.43 
 
 
161 aa  91.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  31.25 
 
 
163 aa  91.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  30.3 
 
 
165 aa  91.7  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  39.29 
 
 
170 aa  91.3  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  31.87 
 
 
161 aa  90.5  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  31.71 
 
 
187 aa  90.5  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  32.03 
 
 
172 aa  90.5  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  33.12 
 
 
166 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  30.77 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  30 
 
 
167 aa  89.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  32.3 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  29.56 
 
 
163 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  30.12 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1002  dihydrofolate reductase  31.68 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  32.65 
 
 
170 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  34.09 
 
 
171 aa  88.6  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  39.26 
 
 
163 aa  89  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  32.12 
 
 
177 aa  88.2  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  32.08 
 
 
170 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  30.82 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  30.67 
 
 
166 aa  88.2  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  31.29 
 
 
162 aa  87.8  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  32.93 
 
 
183 aa  87.8  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  30.49 
 
 
167 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  30.49 
 
 
167 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  30.49 
 
 
167 aa  87.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  30.49 
 
 
167 aa  87.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  30.49 
 
 
167 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  30.49 
 
 
167 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  28.66 
 
 
164 aa  87.4  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
191 aa  86.7  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1581  dihydrofolate reductase  31.06 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.526666  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  35.62 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  32.73 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  30.49 
 
 
167 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  32.08 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  32.52 
 
 
177 aa  87  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  29.63 
 
 
164 aa  87  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  30.43 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>