264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0631 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0631  dihydrofolate reductase region  100 
 
 		 162 aa  337  2.9999999999999998e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1226  dihydrofolate reductase  44.37 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00227067  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1626  dihydrofolate reductase region  38.12 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.337303  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  38.69 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  42.18 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  35.48 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  37.2 
 
 		 165 aa  97.1  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  38.06 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  37.91 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  36.81 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  36.08 
 
 		 175 aa  95.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  37.04 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  36.48 
 
 		 166 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  34.78 
 
 		 169 aa  94.7  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  37.89 
 
 		 177 aa  94.4  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  37.34 
 
 		 167 aa  94  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  35.85 
 
 		 163 aa  94  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  38.03 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  37.11 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  36.88 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  36.71 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  36.48 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  36.77 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  36.65 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  36.48 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  36.2 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  36.48 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  36.48 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  36.48 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  36.48 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  34.57 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  36.48 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  34.73 
 
 		 183 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  35.19 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  36.48 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1610  dihydrofolate reductase region  40.14 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  36.42 
 
 		 171 aa  91.7  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  36.25 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  35.53 
 
 		 177 aa  91.7  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  35.85 
 
 		 167 aa  91.3  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  35.85 
 
 		 167 aa  91.3  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  34.97 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2061  dihydrofolate reductase  39.85 
 
 		 162 aa  90.9  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  38.19 
 
 		 167 aa  90.5  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  32.12 
 
 		 176 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  36.02 
 
 		 162 aa  90.5  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  34.48 
 
 		 162 aa  90.5  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  35.62 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  35 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  42.42 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  38.06 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  36.59 
 
 		 183 aa  90.1  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  37.01 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  35 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  33.55 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  36.13 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  36.49 
 
 		 171 aa  88.2  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  36.13 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  36.49 
 
 		 174 aa  88.2  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  35.19 
 
 		 187 aa  87.8  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  40.3 
 
 		 164 aa  87.4  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  34.84 
 
 		 160 aa  87.4  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  36.18 
 
 		 162 aa  87.4  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  34.27 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  35.17 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  40.62 
 
 		 220 aa  87  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  38.35 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  30.72 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  34.42 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  44.07 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  33.74 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  32.3 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  32.3 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  32.3 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  32.3 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  32.3 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  32.72 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  34.48 
 
 		 168 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  32.93 
 
 		 170 aa  84.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  36 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  36.76 
 
 		 172 aa  84.3  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  32.52 
 
 		 171 aa  84  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  41.8 
 
 		 165 aa  84  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  34.57 
 
 		 179 aa  84  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  36.69 
 
 		 168 aa  84  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  35.77 
 
 		 171 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  32.3 
 
 		 219 aa  84  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  35.77 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  35.77 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  31.68 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  35.57 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  35.33 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  34.25 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  42.37 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  34.51 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  41.18 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1728  dihydrofolate reductase  36.5 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  31.52 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>