271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1226 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1226  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 167 aa  343  4e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00227067  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0631  dihydrofolate reductase region  44.37 
 
 		 162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1626  dihydrofolate reductase region  36.36 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.337303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  38.13 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  31.69 
 
 		 162 aa  98.6  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  35.34 
 
 		 165 aa  97.8  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  36.43 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  36.43 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  36.43 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  36.43 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  36.43 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  36.43 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  36.43 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  35.71 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  35.71 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  35.71 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  31.51 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1314  dihydrofolate reductase  34.33 
 
 		 164 aa  94  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  31.71 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  34.06 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  36.96 
 
 		 171 aa  92  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0164  Dihydrofolate reductase  41.04 
 
 		 165 aa  90.9  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0404291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  35.71 
 
 		 162 aa  90.5  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  33.83 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  37.14 
 
 		 160 aa  90.5  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  33.97 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  34.42 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2031  Dihydrofolate reductase  34.35 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00277782  hitchhiker  0.0000505034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  33.97 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  33.97 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2061  dihydrofolate reductase  38.97 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  31.37 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  33.57 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  35.38 
 
 		 161 aa  88.6  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  30.63 
 
 		 179 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 160 aa  88.2  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  28.19 
 
 		 183 aa  87.8  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  35.88 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  30.82 
 
 		 168 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0989  dihydrofolate reductase region  38.24 
 
 		 156 aa  87.8  7e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  36.92 
 
 		 160 aa  87.8  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  32.48 
 
 		 161 aa  87.4  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  32.3 
 
 		 165 aa  87.4  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  33.96 
 
 		 160 aa  87.4  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0353  dihydrofolate reductase FolA  32.35 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  38.02 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  29.56 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  31.1 
 
 		 178 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  33.59 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  33.76 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  29.66 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  30.59 
 
 		 178 aa  85.9  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0378  dihydrofolate reductase FolA  33.08 
 
 		 163 aa  85.9  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  29.94 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  33.08 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  34.27 
 
 		 169 aa  85.1  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  33.79 
 
 		 220 aa  85.1  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  33.58 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0054  dihydrofolate reductase  36.15 
 
 		 161 aa  85.5  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  33.08 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  30.07 
 
 		 172 aa  84.7  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  34.29 
 
 		 161 aa  84.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0051  dihydrofolate reductase  36.15 
 
 		 161 aa  85.1  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  35 
 
 		 161 aa  84.7  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  30.28 
 
 		 172 aa  84.7  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1610  dihydrofolate reductase region  37.86 
 
 		 155 aa  84.3  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  30.36 
 
 		 167 aa  84.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  30.36 
 
 		 167 aa  84.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  28.77 
 
 		 170 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  35.07 
 
 		 167 aa  84  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  29.81 
 
 		 163 aa  84  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  34.46 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  31.65 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  31.34 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  29.8 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1503  dihydrofolate reductase  32.61 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  32.82 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  32.61 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  35.07 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  34.53 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  34.84 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  34.53 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  35.25 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  33.97 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  32.9 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  35.77 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  30.77 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  35 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  30.67 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  32.87 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  30.32 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  35 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49676  predicted protein  29.41 
 
 		 499 aa  82  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  34.62 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  33.59 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>