265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0989 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0989  dihydrofolate reductase region  100 
 
 		 156 aa  311  9.999999999999999e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1610  dihydrofolate reductase region  39.26 
 
 		 155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  34.72 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  33.79 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  40.97 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  33.54 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  33.54 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  33.54 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  33.54 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  33.54 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  37.23 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2061  dihydrofolate reductase  38.24 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  36.76 
 
 		 161 aa  103  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  38.97 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  35.33 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  42.31 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  35.66 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  37.04 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  38.81 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  38.03 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  31.68 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  31.68 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  38.97 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  31.68 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  31.68 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  31.68 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  31.68 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  34.31 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  34.31 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  36.5 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  35.77 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  35.77 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  35.77 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  34.31 
 
 		 196 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  37.14 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0559  dihydrofolate reductase  36.3 
 
 		 160 aa  97.1  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  40.58 
 
 		 160 aa  97.4  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  37.78 
 
 		 177 aa  97.4  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  37.32 
 
 		 160 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  34.81 
 
 		 160 aa  97.1  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2754  dihydrofolate reductase  37.09 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  39.46 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  38.28 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  33.14 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  35.88 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  37.67 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  35.88 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  41.43 
 
 		 183 aa  95.5  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0054  dihydrofolate reductase  36.23 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  36.64 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  35.04 
 
 		 160 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  31.62 
 
 		 165 aa  94.7  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  37.31 
 
 		 166 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0051  dihydrofolate reductase  34.78 
 
 		 161 aa  94.4  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 160 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  34.25 
 
 		 160 aa  94  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  35.61 
 
 		 162 aa  94  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  34.04 
 
 		 176 aa  94  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  35 
 
 		 168 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 160 aa  94  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  34.03 
 
 		 170 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 		 160 aa  94  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  31.87 
 
 		 163 aa  94  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0353  dihydrofolate reductase FolA  32.06 
 
 		 163 aa  93.6  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  35.46 
 
 		 172 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  29.81 
 
 		 167 aa  93.6  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  36.09 
 
 		 160 aa  92.8  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  36.42 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  31.29 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  34.85 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  34.85 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  34.85 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  30.67 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0378  dihydrofolate reductase FolA  32.82 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  34.85 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  38.46 
 
 		 159 aa  92  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  34.85 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  30.67 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  34.85 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  34.85 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  30.67 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  31.39 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  30.67 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  32.37 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  34.85 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  34.85 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  30.67 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  30.67 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3836  dihydrofolate reductase  33.58 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  30.67 
 
 		 167 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  35.46 
 
 		 179 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  34.27 
 
 		 172 aa  90.9  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  29.93 
 
 		 165 aa  91.3  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  34.75 
 
 		 172 aa  90.9  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  32.14 
 
 		 172 aa  90.9  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  36.43 
 
 		 159 aa  90.9  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>