241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0026 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0026  dihydrofolate reductase region  100 
 
 		 176 aa  350  8.999999999999999e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000208627  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1542  dihydrofolate reductase region  39.53 
 
 		 197 aa  114  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1150  dihydrofolate reductase-like protein  37.28 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1305  dihydrofolate reductase-like protein  37.28 
 
 		 169 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0646  dihydrofolate reductase region  40.46 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl383  dihydrofolate reductase  33.12 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0297062  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.67 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.17 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.67 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  27.45 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  29.8 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01181  RibD/RibG domain-containing protein  29.29 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  27.67 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  30.92 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  30 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  27.67 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  31.51 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  29.14 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  29.14 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  28.87 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  31.2 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0127  dihydrofolate reductase  31.58 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  30.94 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1728  dihydrofolate reductase  26.44 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01771  RibD/RibG domain-containing protein  36.47 
 
 		 225 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.159904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  26.28 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  32.08 
 
 		 161 aa  52.4  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  32.08 
 
 		 161 aa  52.4  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  28.06 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  25.97 
 
 		 160 aa  52  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  27.27 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  27.27 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  32.85 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  27.27 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  32.37 
 
 		 161 aa  51.6  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1161  riboflavin biosynthesis protein RibD  26.24 
 
 		 357 aa  51.2  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  43.28 
 
 		 160 aa  50.8  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  26.52 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5288  deaminase-reductase domain-containing protein  31.87 
 
 		 252 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122038  normal  0.871149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  25.83 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0561  dihydrofolate reductase  30.33 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  28.48 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.13 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  25.77 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  27.98 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  27.98 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  28.86 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  30.94 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  32.39 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  27.38 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  21.84 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  43.08 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  28.67 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1474  pyrimidine reductase  34.12 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  32.86 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  30.25 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  31.75 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  28.06 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  31.58 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  32.3 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  31.88 
 
 		 209 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  28.45 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  28.45 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  32.12 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1626  dihydrofolate reductase region  32.48 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.337303  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  27.14 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  32.12 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  31.65 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  28.45 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  28.45 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  28.45 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  29.41 
 
 		 173 aa  48.5  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  29.03 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  26.22 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  29.68 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  29.14 
 
 		 173 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  31.65 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  31.79 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2048  dihydrofolate reductase  31.67 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  26.35 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  28.78 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  31.25 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  30.6 
 
 		 181 aa  48.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  30.3 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  31.25 
 
 		 167 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.11 
 
 		 182 aa  47.8  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  30.37 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.22 
 
 		 182 aa  47.8  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  24.44 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  30.88 
 
 		 170 aa  47.8  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.31 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  25.5 
 
 		 171 aa  47.8  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1612  deaminase-reductase domain-containing protein  27.1 
 
 		 218 aa  47.8  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  43.4 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  28.97 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  30.22 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  37.89 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  40.3 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  24.83 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>