271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1542 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1542  dihydrofolate reductase region  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0026  dihydrofolate reductase region  39.53 
 
 		 176 aa  114  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000208627  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0646  dihydrofolate reductase region  41.76 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1150  dihydrofolate reductase-like protein  40.24 
 
 		 169 aa  108  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1305  dihydrofolate reductase-like protein  39.88 
 
 		 169 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  34.15 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  41.94 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  32.79 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  36.92 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  28.36 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  31.25 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  36.52 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  31.78 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  31.58 
 
 		 167 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  28.17 
 
 		 179 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  32.56 
 
 		 163 aa  62  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  32.17 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  31.45 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  36.11 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  31.58 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  31.4 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  31.58 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  31.58 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  31.58 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2988  Dihydrofolate reductase  37.4 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.302882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  31.58 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  31.01 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  32.19 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  32.85 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  31.16 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  31.01 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  32.2 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  31.58 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  34.68 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  31.01 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  37.86 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  32.79 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  32.79 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  27.1 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  31.15 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  30.93 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  31.54 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  29.61 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  31.97 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  30.89 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1653  Dihydrofolate reductase  29.87 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  30.6 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  32.79 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  31.06 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2031  Dihydrofolate reductase  36.96 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00277782  hitchhiker  0.0000505034 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1002  dihydrofolate reductase  31.01 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1515  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  30.16 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  33.9 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  35.83 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1486  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.471201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3263  dihydrofolate reductase  34.11 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.254952  normal  0.239963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  31.86 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  35.19 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  33.85 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  32.33 
 
 		 160 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  30.83 
 
 		 160 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  30.83 
 
 		 160 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  32.33 
 
 		 160 aa  57  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  30.83 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2754  dihydrofolate reductase  35.42 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  35.79 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  30.37 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  32.48 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  35.85 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2312  dihydrofolate reductase  30.23 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312727  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2167  dihydrofolate reductase region  36.54 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  28.86 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  34.91 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  31.45 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  32.5 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  32.12 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1226  dihydrofolate reductase  39.81 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00227067  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  32.37 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  31.58 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  35.19 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  28.67 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  34.26 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  32.76 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  28.95 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  28.95 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  31.58 
 
 		 167 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  33.62 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  32.5 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  33.68 
 
 		 162 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  29.2 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  35.11 
 
 		 169 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  29.2 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  29.55 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  28.95 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1581  dihydrofolate reductase  29.46 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.526666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  29 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  31.9 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  34.95 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1926  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000147298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>