194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5103 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  100 
 
 
177 aa  348  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  81.25 
 
 
199 aa  293  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  78.41 
 
 
178 aa  288  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  76 
 
 
180 aa  269  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  44.32 
 
 
181 aa  162  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  52.25 
 
 
173 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  43.75 
 
 
181 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  49.42 
 
 
207 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52.57 
 
 
212 aa  157  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.76 
 
 
178 aa  153  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  46.33 
 
 
183 aa  147  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  45.2 
 
 
183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.46 
 
 
181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.76 
 
 
183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  45.76 
 
 
183 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  45.76 
 
 
183 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  42.86 
 
 
390 aa  144  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.31 
 
 
176 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  38.6 
 
 
178 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  43.27 
 
 
177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  39.2 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  36.63 
 
 
181 aa  131  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.84 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  45.16 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  37.43 
 
 
183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  41.86 
 
 
180 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  44.51 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  39.53 
 
 
178 aa  124  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.42 
 
 
177 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  38.6 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  33.89 
 
 
176 aa  119  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.66 
 
 
175 aa  117  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  42.7 
 
 
176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  39.66 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  35.43 
 
 
172 aa  111  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.71 
 
 
182 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  40.23 
 
 
177 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  40.23 
 
 
177 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  40.66 
 
 
184 aa  105  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  38.15 
 
 
177 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  37.22 
 
 
192 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  37.21 
 
 
194 aa  97.4  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.17 
 
 
184 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.29 
 
 
184 aa  95.1  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03197  dihydrofolate reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06820)  36.6 
 
 
210 aa  94.4  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.245608 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.57 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  31.43 
 
 
173 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  32 
 
 
174 aa  88.6  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  33.33 
 
 
173 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  33.52 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.86 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  31.43 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  32.18 
 
 
173 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  32.95 
 
 
173 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  32.95 
 
 
173 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.86 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  30.29 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.12 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  34.08 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.08 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.59 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  34.08 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  31.02 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.52 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  34.83 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  32.79 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.8 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  33.69 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.55 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  32.24 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.09 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.15 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  30.6 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.22 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  24.86 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.4 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.35 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  29.35 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.93 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  26.23 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.33 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  31.05 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06432  dihydrofolate reductase  38.03 
 
 
75 aa  62.4  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  28.8 
 
 
188 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  28.28 
 
 
173 aa  62  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.68 
 
 
187 aa  61.6  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  31.89 
 
 
186 aa  61.6  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1674  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  32.91 
 
 
386 aa  61.2  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.73 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1669  riboflavin biosynthesis protein RibD  33.74 
 
 
373 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.04431e-16 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.32 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.26 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.71 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  31.91 
 
 
195 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.85 
 
 
187 aa  58.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  28.25 
 
 
187 aa  58.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.53 
 
 
179 aa  58.9  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>