267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82622 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_82622  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 203 aa  416  9.999999999999999e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.778067 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_1690  predicted protein  41.61 
 
 		 495 aa  123  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49676  predicted protein  40 
 
 		 499 aa  120  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21688 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01940  dihydrofolate reductase, putative  34.39 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5413  Dihydrofolate reductase  32.47 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389399  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  40.44 
 
 		 165 aa  94.7  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  40.91 
 
 		 166 aa  92.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 164 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  30.77 
 
 		 165 aa  89  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  35.57 
 
 		 166 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  30.77 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  38.06 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  40.52 
 
 		 163 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  37.98 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  33.88 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  38.46 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  33.54 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  35.97 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  35.33 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  35.1 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  34.13 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  37.12 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  34.21 
 
 		 169 aa  80.9  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  35.16 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  33.1 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  32.65 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  34.97 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  29.23 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0405  dihydrofolate reductase  32.7 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  32.35 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  31.87 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  34.84 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2031  Dihydrofolate reductase  36.36 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00277782  hitchhiker  0.0000505034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  29.23 
 
 		 171 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  35.71 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  37.01 
 
 		 160 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  35.71 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  35.71 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  37.04 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  34.11 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  38.1 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  30.13 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  30.41 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  35.65 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  40.48 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  33.76 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1002  dihydrofolate reductase  33.73 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64057  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0561  dihydrofolate reductase  38.71 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  34.62 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1581  dihydrofolate reductase  33.73 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.526666  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  33.52 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  33.97 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  34.3 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  34.62 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  33.97 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  31.1 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  33.97 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  32.54 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  33.52 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  34.58 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  29.29 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  33.12 
 
 		 164 aa  72  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  32.1 
 
 		 170 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  29.27 
 
 		 172 aa  72  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  28.83 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  29.63 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  33.09 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  32.92 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  32.54 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0164  Dihydrofolate reductase  32.81 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0404291  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  33.58 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  33.12 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  34.25 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  36.63 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  32.69 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 161 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  29.29 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1610  dihydrofolate reductase region  31.58 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  33.77 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  32.62 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  36.72 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  35.86 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  32.69 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1226  dihydrofolate reductase  32.26 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00227067  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  32.41 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  27.56 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  29.03 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  34.96 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  35.06 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  31.72 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  31.72 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  32.37 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  33.11 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  33.11 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>