208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05290 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  50.83 
 
 
184 aa  171  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.89 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  43.02 
 
 
181 aa  142  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  42.39 
 
 
390 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  42.46 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.8 
 
 
186 aa  138  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  44.97 
 
 
180 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  43.39 
 
 
178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  43.62 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03197  dihydrofolate reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06820)  37.62 
 
 
210 aa  130  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.245608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  45.16 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  43.09 
 
 
176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  41.88 
 
 
199 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.98 
 
 
178 aa  122  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  41.34 
 
 
173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.78 
 
 
181 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  36.52 
 
 
178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  37.08 
 
 
181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  37.43 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.67 
 
 
176 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  36.42 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  36.42 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  38.17 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  37.64 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  37.08 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  38.89 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  36.72 
 
 
177 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  35.29 
 
 
175 aa  109  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  37.22 
 
 
183 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.63 
 
 
183 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  38.17 
 
 
183 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  38.2 
 
 
177 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.45 
 
 
184 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.23 
 
 
174 aa  99  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  34.44 
 
 
175 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  35.03 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.71 
 
 
184 aa  92  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  32.95 
 
 
180 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  32.22 
 
 
172 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  33.16 
 
 
192 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  34.2 
 
 
199 aa  89.7  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.91 
 
 
177 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.67 
 
 
188 aa  88.6  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.41 
 
 
182 aa  87.8  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  34.08 
 
 
180 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  28.81 
 
 
173 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  29.38 
 
 
174 aa  84.7  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  28.81 
 
 
173 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.25 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  28.81 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  29.38 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  29.38 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  28.25 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  27.68 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  28.81 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.11 
 
 
175 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  27.84 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  29.51 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.07 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.18 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  30.43 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.49 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  25.14 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  29.57 
 
 
182 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  28.21 
 
 
173 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.26 
 
 
180 aa  63.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.54 
 
 
178 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.66 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  29.47 
 
 
193 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  29.02 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
199 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  28.72 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.63 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.21 
 
 
187 aa  59.3  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  28.03 
 
 
172 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06432  dihydrofolate reductase  36.62 
 
 
75 aa  59.3  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.53 
 
 
189 aa  58.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  32.5 
 
 
190 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.61 
 
 
193 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  31.47 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  32.63 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.22 
 
 
177 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  29.22 
 
 
177 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.22 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.48 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.98 
 
 
185 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  30.21 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  27.07 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.94 
 
 
173 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  29.38 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  28.21 
 
 
193 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  32.7 
 
 
190 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.1 
 
 
206 aa  55.1  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  28.18 
 
 
189 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  26.88 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.56 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1305  dihydrofolate reductase-like protein  27.45 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.66 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>