244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1460 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
193 aa  396  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  52.41 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  51.34 
 
 
195 aa  197  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  47.89 
 
 
191 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.48 
 
 
197 aa  175  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.6 
 
 
191 aa  174  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  47.92 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.68 
 
 
191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.011161  hitchhiker  0.00121534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  46.28 
 
 
191 aa  170  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.03 
 
 
189 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  49.41 
 
 
198 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  44.81 
 
 
192 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  45.05 
 
 
190 aa  167  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32930  dihydrofolate reductase  46.32 
 
 
194 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  43.98 
 
 
190 aa  164  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3404  riboflavin biosynthesis protein RibD  47.87 
 
 
196 aa  161  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0724  dihydrofolate reductase family protein  43.01 
 
 
197 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  45.45 
 
 
191 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.71 
 
 
182 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  33.16 
 
 
194 aa  102  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.56 
 
 
179 aa  99  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  31.35 
 
 
174 aa  93.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.65 
 
 
178 aa  91.3  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  31.35 
 
 
173 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.81 
 
 
174 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  30.81 
 
 
173 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  30.77 
 
 
172 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  30.27 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  29.73 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  29.73 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  29.73 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  29.73 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  29.89 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  29.08 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.93 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.2 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  32.99 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  32.29 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  29.57 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 
181 aa  79  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.84 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  31.22 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  30.21 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  33.51 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  31.72 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  31.72 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  30.11 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  28.04 
 
 
199 aa  74.3  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.69 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  30.1 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.63 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.85 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.16 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.5 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.24 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  28.8 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  25.41 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  31.21 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  32.45 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  33.13 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  29.84 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.44 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.77 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  29.03 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  29.51 
 
 
390 aa  68.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.71 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  29.69 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.43 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.93 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.52 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.65 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.67 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.43 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  28.34 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.22 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  30.73 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.53 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.47 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  30.73 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  28.86 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  30.81 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  28.35 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.6 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.61 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  31.05 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  26.29 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.51 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  26.77 
 
 
180 aa  62  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  27.72 
 
 
173 aa  61.2  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  25.71 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.78 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  26.29 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.21 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.85 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.15 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  28.19 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  31.46 
 
 
184 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>