158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1850 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  100 
 
 		 176 aa  361  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  62.29 
 
 		 175 aa  221  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.89 
 
 		 179 aa  137  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  29.26 
 
 		 191 aa  87.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  31.77 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  31.75 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.32 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.74 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.26 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  30.21 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.61 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  29.59 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  31.43 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.89 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  33.73 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  32.76 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.76 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.63 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  32.76 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  32.76 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.76 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  30.46 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32930  dihydrofolate reductase  29.76 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  31.03 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0724  dihydrofolate reductase family protein  32.16 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.758945 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  31.61 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  29.41 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.49 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.16 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  29.41 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.53 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.011161  hitchhiker  0.00121534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  34.3 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.61 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.14 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.51 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  29.34 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  32.74 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  29.8 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  27.22 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.82 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  25.95 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.32 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3404  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.94 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  33.96 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  26.58 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.31 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  27.88 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  26.58 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  25.16 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  27.72 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.44 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  26.42 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  27.04 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  25.32 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  25.32 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.43 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  31.51 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  25.32 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.06 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  26.55 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.34 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  32.08 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  27.22 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.26 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.07 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  25.29 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  31.4 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3984  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.27 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  32 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  29.09 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.11 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.13 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  23.75 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  27.27 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.53 
 
 		 187 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  27.41 
 
 		 189 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.73 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  27.06 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  24.12 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.16 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.15 
 
 		 187 aa  51.6  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  26.47 
 
 		 181 aa  50.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.84 
 
 		 188 aa  50.8  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  29.28 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.1 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  24.12 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  28.18 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.26 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.49 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  25.93 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  27.45 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.24 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  28.09 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.05 
 
 		 188 aa  48.5  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.37 
 
 		 197 aa  47.8  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  33.12 
 
 		 182 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>