176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3207 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 191 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  58.2 
 
 		 192 aa  228  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0724  dihydrofolate reductase family protein  58.03 
 
 		 197 aa  217  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.758945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  55.61 
 
 		 190 aa  212  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.95 
 
 		 191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.011161  hitchhiker  0.00121534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  56.15 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  53.19 
 
 		 193 aa  197  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  51.32 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  51.06 
 
 		 195 aa  184  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32930  dihydrofolate reductase  50.26 
 
 		 194 aa  180  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  49.47 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.17 
 
 		 189 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  46.6 
 
 		 193 aa  174  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  47.96 
 
 		 198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3404  riboflavin biosynthesis protein RibD  47.62 
 
 		 196 aa  158  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  38.22 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  44.97 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.1 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  32.8 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 		 182 aa  91.3  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.93 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  26.29 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  29.38 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  35.26 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  28.57 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  28.22 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  28.04 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  28.57 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.06 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  29.27 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.09 
 
 		 194 aa  72  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  28.04 
 
 		 173 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  26.29 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  28.04 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.75 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  27.51 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  27.51 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.4 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  31.22 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  27.51 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.8 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  32.31 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.26 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  27.75 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  28.8 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  28.27 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  27.66 
 
 		 173 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  28.27 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  24.87 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.8 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  29.63 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.12 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  27.92 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  27.32 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  22.22 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.73 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  25.98 
 
 		 181 aa  62  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  27.14 
 
 		 178 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.08 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  27.36 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.67 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  27.09 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  28.95 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  28.25 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.86 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.65 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.76 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.74 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.27 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  27.51 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.55 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  25.53 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  30.05 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.7 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  27.01 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.3 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  26.7 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  33 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  36.07 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  30.81 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  36.46 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.51 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.82 
 
 		 178 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.35 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.27 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  24.5 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.9 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  26.46 
 
 		 178 aa  51.2  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  27.45 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.46 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  26.26 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.53 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.15 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.35 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.86 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>