111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0724 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0724  dihydrofolate reductase family protein  100 
 
 
197 aa  397  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  58.88 
 
 
192 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  60 
 
 
190 aa  225  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  60.51 
 
 
190 aa  219  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.03 
 
 
191 aa  217  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52.55 
 
 
191 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.011161  hitchhiker  0.00121534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  49.21 
 
 
193 aa  181  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  48.98 
 
 
191 aa  177  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  48.21 
 
 
195 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.45 
 
 
189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  46.7 
 
 
195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  43.01 
 
 
193 aa  155  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32930  dihydrofolate reductase  46.46 
 
 
194 aa  154  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3404  riboflavin biosynthesis protein RibD  44.33 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  44.1 
 
 
191 aa  135  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  38.14 
 
 
191 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.78 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  41.12 
 
 
198 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.17 
 
 
182 aa  85.9  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.64 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  30.61 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  27.69 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  26.63 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  26.9 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  32.16 
 
 
176 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  28.8 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  29.35 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  26.8 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  27.18 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  26.67 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  26.29 
 
 
173 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  26.29 
 
 
173 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.38 
 
 
209 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  26.15 
 
 
173 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.73 
 
 
188 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  28.72 
 
 
180 aa  62.4  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  26.29 
 
 
173 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  28.43 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 
181 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.35 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  31.72 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29 
 
 
177 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  27.36 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  31.91 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.23 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  27.14 
 
 
199 aa  55.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.64 
 
 
179 aa  55.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.82 
 
 
188 aa  55.5  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  25.13 
 
 
174 aa  55.1  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  29.21 
 
 
182 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  24.02 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  26.44 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.25 
 
 
185 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  25.89 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  25.77 
 
 
178 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  26.42 
 
 
177 aa  52.8  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.68 
 
 
180 aa  52  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  26.51 
 
 
228 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.14 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  23.26 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.33 
 
 
221 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.06 
 
 
194 aa  48.9  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.96 
 
 
189 aa  48.9  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.49 
 
 
176 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.22 
 
 
180 aa  48.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.13 
 
 
178 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.64 
 
 
204 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.74 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  26.83 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  24.37 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.37 
 
 
183 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  26.26 
 
 
186 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  28.47 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.38 
 
 
175 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  24.37 
 
 
183 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.36 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  24.37 
 
 
183 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 
183 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.82 
 
 
188 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.38 
 
 
217 aa  45.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.37 
 
 
181 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  29.78 
 
 
180 aa  45.1  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.37 
 
 
179 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
204 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.4 
 
 
192 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  29.82 
 
 
180 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  23.47 
 
 
183 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.67 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.29 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  36.56 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.16 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  25.12 
 
 
184 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  25.64 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.91 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.41 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.45 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.6 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  24.51 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.26 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>