219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00910 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  100 
 
 
183 aa  375  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  61.33 
 
 
181 aa  220  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  59.56 
 
 
186 aa  213  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  60.11 
 
 
185 aa  202  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  34.08 
 
 
178 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.49 
 
 
180 aa  104  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.9 
 
 
201 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  39.71 
 
 
183 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  34.84 
 
 
181 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.55 
 
 
204 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.29 
 
 
187 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.3 
 
 
219 aa  98.6  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.43 
 
 
180 aa  98.2  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  37.65 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.34 
 
 
204 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.07 
 
 
217 aa  95.5  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.48 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.6 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
187 aa  91.7  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  37.04 
 
 
204 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.5 
 
 
178 aa  91.3  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.5 
 
 
212 aa  90.5  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.08 
 
 
204 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  34.97 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
178 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.06 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.23 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  34.39 
 
 
215 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.94 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.57 
 
 
224 aa  89  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.06 
 
 
201 aa  89  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.72 
 
 
189 aa  88.2  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  35.29 
 
 
183 aa  87.8  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.19 
 
 
182 aa  87.8  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  42.98 
 
 
221 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.61 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  43.2 
 
 
213 aa  87  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.24 
 
 
201 aa  87  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  32.54 
 
 
199 aa  86.3  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
200 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.73 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.77 
 
 
181 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  32.7 
 
 
180 aa  85.1  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  34 
 
 
187 aa  84.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.35 
 
 
221 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  40.91 
 
 
221 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  38.73 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  37.61 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  35.62 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.18 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  39.57 
 
 
196 aa  82  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.02 
 
 
203 aa  82  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  32.57 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  31.95 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  35.85 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.21 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.3 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34 
 
 
157 aa  79  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.35 
 
 
192 aa  79  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.29 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.24 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.55 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  37.68 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.96 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  39.66 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.85 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.6 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  29.19 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  36.61 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  32.61 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.09 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.26 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.55 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.84 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  28.78 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  29.26 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.64 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.33 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3623  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.29 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.87 
 
 
194 aa  72  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.24 
 
 
193 aa  72  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  34.81 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.27 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  34.27 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  34.27 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.42 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.98 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.29 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  30.57 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  28.87 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  35.58 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  39.29 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.28 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  30.39 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>