184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3841 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
196 aa  387  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1772  bifunctional deaminase-reductase domain protein  64.29 
 
 
209 aa  250  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1728  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.57 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2274  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  45.11 
 
 
192 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2661  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.48 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.277256  normal  0.275954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.33 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.6 
 
 
201 aa  85.9  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  30.22 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  33.09 
 
 
183 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.43 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.78 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.73 
 
 
204 aa  82  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.95 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.42 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.51 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.32 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  32.04 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  31.15 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.49 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.96 
 
 
178 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.77 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  36.08 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.14 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  30.73 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.49 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  35.76 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  35.79 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  34.16 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.18 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  31.75 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.59 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  35.14 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.29 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.89 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.23 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  35.23 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  30.16 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  36.29 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.45 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.97 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  29.26 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  31.43 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.62 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  35.25 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.63 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.11 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  29.57 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.35 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.42 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.48 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.4 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  30.98 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.96 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.9 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.63 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  30.86 
 
 
205 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.97 
 
 
183 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  28.74 
 
 
198 aa  62  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.29 
 
 
192 aa  62  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.93 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.21 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.38 
 
 
186 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.25 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.6 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.91 
 
 
187 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.52 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.06 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.39 
 
 
217 aa  58.9  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  32.45 
 
 
187 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  35.19 
 
 
187 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  26.94 
 
 
219 aa  58.5  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.68 
 
 
181 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.57 
 
 
209 aa  58.2  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  32.64 
 
 
203 aa  58.2  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  39.58 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.35 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.56 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.07 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.38 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.25 
 
 
182 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.48 
 
 
183 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  26.49 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.9 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.13 
 
 
196 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2397  dihydrofolate reductase  31.73 
 
 
116 aa  55.5  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.37 
 
 
183 aa  55.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.29 
 
 
181 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  29.93 
 
 
180 aa  55.1  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
197 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.88 
 
 
209 aa  55.1  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.12 
 
 
192 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  27.51 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  30.46 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  31.68 
 
 
178 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>