116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2661 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2661  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
192 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.277256  normal  0.275954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2274  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  65.28 
 
 
192 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1728  bifunctional deaminase-reductase domain protein  66.32 
 
 
192 aa  251  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.48 
 
 
196 aa  130  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1772  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.94 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.41 
 
 
189 aa  72  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.61 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  39.22 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.68 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.74 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.58 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.76 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.42 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.18 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.05 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  32.37 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  31.88 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.57 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.75 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  35.25 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.13 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.67 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  41.59 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.3 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
208 aa  61.6  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
201 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.71 
 
 
187 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
201 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.11 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.96 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.25 
 
 
180 aa  58.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.96 
 
 
221 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  31.21 
 
 
221 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.01 
 
 
224 aa  57.8  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  32.96 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.43 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.69 
 
 
185 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  29.41 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.34 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.75 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.08 
 
 
221 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.85 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  31.43 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.41 
 
 
209 aa  55.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  30.36 
 
 
183 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  34.62 
 
 
196 aa  55.1  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.12 
 
 
221 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  40.58 
 
 
186 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.13 
 
 
178 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.1 
 
 
219 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.74 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.33 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  27.33 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.41 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  29.03 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.16 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.23 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5654  hypothetical protein  37.93 
 
 
122 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316423  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  29.09 
 
 
215 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.31 
 
 
203 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.91 
 
 
190 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.03 
 
 
181 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.32 
 
 
204 aa  52  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  30.16 
 
 
189 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.19 
 
 
189 aa  52  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  31.76 
 
 
199 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  26.81 
 
 
178 aa  51.2  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  39.58 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.69 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.91 
 
 
188 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  31.22 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.03 
 
 
157 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
192 aa  48.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  31.4 
 
 
180 aa  48.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  36.72 
 
 
213 aa  48.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.73 
 
 
187 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.43 
 
 
190 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  37.66 
 
 
187 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  28.85 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.7 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.78 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.2 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.17 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.21 
 
 
188 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  28.4 
 
 
179 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.22 
 
 
189 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.33 
 
 
182 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.96 
 
 
197 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.01 
 
 
176 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.51 
 
 
182 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.41 
 
 
188 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  26.9 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.64 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.93 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.68 
 
 
192 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  33.85 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>