117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5654 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5654  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  240  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316423  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  77.27 
 
 
181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  53.49 
 
 
183 aa  88.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  53.49 
 
 
178 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.8 
 
 
192 aa  83.6  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  39.09 
 
 
186 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.86 
 
 
181 aa  70.5  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  45.45 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  41.38 
 
 
203 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.7 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  35.29 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  35.29 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.48 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  38.37 
 
 
183 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.82 
 
 
224 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.37 
 
 
204 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.98 
 
 
188 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.23 
 
 
182 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  47.69 
 
 
201 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  38.37 
 
 
215 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  43.37 
 
 
180 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  46.34 
 
 
199 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.77 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.62 
 
 
185 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.67 
 
 
212 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.29 
 
 
201 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.67 
 
 
204 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.78 
 
 
221 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.7 
 
 
185 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.69 
 
 
183 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.07 
 
 
183 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  37.65 
 
 
167 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 
177 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  38.1 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  30.28 
 
 
180 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 
204 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.9 
 
 
197 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
217 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  41.25 
 
 
203 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.14 
 
 
200 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.37 
 
 
178 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.9 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.8 
 
 
196 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  34.12 
 
 
181 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  36.9 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.71 
 
 
208 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.7 
 
 
178 aa  52  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.73 
 
 
199 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  41.25 
 
 
219 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50 
 
 
183 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  34.88 
 
 
188 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  48.28 
 
 
183 aa  51.6  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.58 
 
 
221 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
187 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  34.88 
 
 
188 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.76 
 
 
188 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  40.58 
 
 
221 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.73 
 
 
190 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.77 
 
 
179 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.21 
 
 
189 aa  50.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.12 
 
 
189 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  43.64 
 
 
187 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.73 
 
 
221 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
188 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  28.83 
 
 
228 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  41.38 
 
 
178 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.22 
 
 
192 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.37 
 
 
177 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2274  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.36 
 
 
192 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.75 
 
 
180 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.33 
 
 
196 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.76 
 
 
204 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.85 
 
 
190 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  31.76 
 
 
185 aa  47  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.76 
 
 
181 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  48.98 
 
 
192 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  36.89 
 
 
213 aa  47  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.8 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1728  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.52 
 
 
192 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.14 
 
 
208 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.95 
 
 
202 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.33 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.21 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.8 
 
 
209 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2661  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.66 
 
 
192 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.277256  normal  0.275954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  35.53 
 
 
192 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  36.47 
 
 
208 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1772  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.33 
 
 
209 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187954 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  37.18 
 
 
198 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3214  dihydrofolate reductase, putative  34.62 
 
 
57 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.633865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  44.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  46 
 
 
180 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.4 
 
 
204 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.71 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  37.84 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  31.51 
 
 
200 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.29 
 
 
210 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.86 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.73 
 
 
188 aa  42.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.12 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>