291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7425 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
178 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  80.79 
 
 
177 aa  295  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.94 
 
 
178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.64 
 
 
180 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  37.22 
 
 
181 aa  121  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.49 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  36.11 
 
 
181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  37.08 
 
 
178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.65 
 
 
201 aa  117  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.56 
 
 
180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  36.72 
 
 
181 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.51 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.11 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  35.91 
 
 
183 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.96 
 
 
183 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.72 
 
 
179 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  34.41 
 
 
215 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  36.41 
 
 
219 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.43 
 
 
188 aa  101  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  36.98 
 
 
208 aa  101  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  33.93 
 
 
204 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  39.57 
 
 
190 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.25 
 
 
204 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.71 
 
 
187 aa  99.4  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.7 
 
 
204 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.52 
 
 
200 aa  99  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  32.18 
 
 
178 aa  98.6  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.35 
 
 
202 aa  97.8  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
182 aa  97.4  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  34.41 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  38.31 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.59 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.94 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  36.36 
 
 
198 aa  95.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  35.57 
 
 
221 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.54 
 
 
221 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  33.52 
 
 
199 aa  94.4  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.73 
 
 
181 aa  93.6  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.97 
 
 
203 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  31.18 
 
 
185 aa  92.8  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.14 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.14 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.27 
 
 
212 aa  92.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  35.34 
 
 
179 aa  92  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.42 
 
 
197 aa  91.7  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
190 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.16 
 
 
219 aa  89.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  30.94 
 
 
183 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.02 
 
 
221 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  32.2 
 
 
178 aa  88.2  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.56 
 
 
201 aa  88.2  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.44 
 
 
178 aa  88.2  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  39.52 
 
 
181 aa  87.4  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.14 
 
 
188 aa  87  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.77 
 
 
210 aa  87  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.84 
 
 
176 aa  87  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.13 
 
 
194 aa  86.3  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.73 
 
 
186 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  40.58 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  36.27 
 
 
187 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.09 
 
 
187 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.85 
 
 
189 aa  84.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.2 
 
 
204 aa  84.3  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.22 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.39 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.02 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1772  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.52 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.39 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.99 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.48 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.99 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.99 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.7 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  33.73 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.48 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  31.48 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.46 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.71 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  31.03 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.91 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  34.55 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.96 
 
 
196 aa  77  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.15 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.96 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  30.77 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.57 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  33.5 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.22 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.19 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  35.19 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  36.25 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  28.21 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2274  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.71 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  33.68 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.13 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>