237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1904 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
200 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.03 
 
 
197 aa  234  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  50 
 
 
196 aa  186  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.77 
 
 
201 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
204 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.96 
 
 
212 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.12 
 
 
219 aa  147  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.94 
 
 
204 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.54 
 
 
201 aa  141  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  41.41 
 
 
201 aa  141  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  41.38 
 
 
221 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  42.21 
 
 
198 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.4 
 
 
204 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.9 
 
 
221 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
228 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.89 
 
 
221 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  39.25 
 
 
215 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  34.52 
 
 
181 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.88 
 
 
221 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.35 
 
 
217 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  40.41 
 
 
181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.7 
 
 
224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.22 
 
 
192 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.49 
 
 
181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.76 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  37.56 
 
 
218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.94 
 
 
180 aa  125  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  37.24 
 
 
208 aa  124  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  39.09 
 
 
200 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.15 
 
 
209 aa  123  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  39.04 
 
 
221 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  35.6 
 
 
219 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.56 
 
 
210 aa  121  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  36.79 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  37.24 
 
 
180 aa  119  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.63 
 
 
179 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  38.76 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.21 
 
 
204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  38.74 
 
 
178 aa  118  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.3 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.27 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  34.02 
 
 
183 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  37.06 
 
 
199 aa  114  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  39.69 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.66 
 
 
204 aa  112  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  39.3 
 
 
203 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  38.07 
 
 
213 aa  108  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.89 
 
 
199 aa  108  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  38.86 
 
 
205 aa  107  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.51 
 
 
200 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.43 
 
 
178 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  38.54 
 
 
208 aa  104  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.79 
 
 
183 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.08 
 
 
208 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.87 
 
 
190 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.55 
 
 
181 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  34.69 
 
 
183 aa  101  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  33.16 
 
 
183 aa  101  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
189 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.12 
 
 
217 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  40.12 
 
 
217 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  40.12 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.52 
 
 
178 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.55 
 
 
209 aa  99  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.65 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.73 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.61 
 
 
187 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.53 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.05 
 
 
178 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.57 
 
 
185 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  34.9 
 
 
214 aa  92  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.94 
 
 
181 aa  91.3  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.62 
 
 
186 aa  91.3  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.38 
 
 
189 aa  90.9  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  30.69 
 
 
185 aa  91.3  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.01 
 
 
185 aa  90.9  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.69 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.59 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  33.16 
 
 
199 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  34.54 
 
 
192 aa  88.6  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.77 
 
 
194 aa  88.6  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.25 
 
 
188 aa  89  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  34.69 
 
 
179 aa  87.8  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  34.76 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.89 
 
 
177 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 
183 aa  87  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  35.71 
 
 
200 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.17 
 
 
221 aa  84  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.16 
 
 
190 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  32.65 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.9 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  33.95 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.28 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.33 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3213  putative secreted protein  36.04 
 
 
98 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.82639  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  31.06 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  29.85 
 
 
189 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.99 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.66 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>