284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4299 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
188 aa  391  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.92 
 
 
192 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.62 
 
 
188 aa  156  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  37.77 
 
 
189 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.77 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2397  dihydrofolate reductase  53.57 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.45 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  34.21 
 
 
190 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  32.26 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.41 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.41 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  34.08 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  32.63 
 
 
178 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  30.65 
 
 
199 aa  108  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 
186 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 
183 aa  107  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  31.18 
 
 
185 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
187 aa  105  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2398  dihydrofolate reductase  66.15 
 
 
65 aa  104  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  32.8 
 
 
187 aa  104  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.38 
 
 
194 aa  104  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.18 
 
 
187 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.03 
 
 
188 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  29.03 
 
 
188 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.53 
 
 
185 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  29.03 
 
 
188 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.17 
 
 
190 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  30.65 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 
184 aa  99  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.38 
 
 
187 aa  97.8  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  32.98 
 
 
178 aa  97.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.27 
 
 
181 aa  97.8  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.18 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.71 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  29.19 
 
 
182 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  31.22 
 
 
181 aa  95.5  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.18 
 
 
178 aa  94  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  27.84 
 
 
196 aa  94  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.29 
 
 
185 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.73 
 
 
182 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.77 
 
 
187 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  33.16 
 
 
172 aa  92  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  30.69 
 
 
198 aa  92  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  32.98 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.19 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.11 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1085  deaminase-reductase domain-containing protein  31.96 
 
 
197 aa  89  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.655465  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  30.85 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.49 
 
 
189 aa  87.8  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  28.73 
 
 
179 aa  87  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.95 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.32 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  29.26 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.69 
 
 
203 aa  86.3  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  32.98 
 
 
177 aa  86.3  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.95 
 
 
179 aa  84.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  32.62 
 
 
181 aa  84.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.69 
 
 
182 aa  84.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.35 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  32.98 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  29.23 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  30.53 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.05 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.55 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  30.11 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.96 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  27.32 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.42 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.71 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.69 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.67 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  29.35 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  31.5 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.87 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.17 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  29.26 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  30.05 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  28.16 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.16 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.54 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  29.41 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  31.18 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  30 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.79 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.23 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 
195 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.1 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  26.18 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  30.38 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  29.1 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.32 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  24.63 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.12 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  27.18 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.92 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  28.8 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>