197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0489 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
176 aa  352  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  71.43 
 
 
176 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  70.45 
 
 
176 aa  263  8.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  69.32 
 
 
176 aa  262  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  62.5 
 
 
177 aa  232  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.11 
 
 
182 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  38.38 
 
 
190 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  34.25 
 
 
182 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  39.89 
 
 
188 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.34 
 
 
188 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  39.34 
 
 
188 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  38.8 
 
 
199 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.11 
 
 
182 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  40 
 
 
196 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  37.3 
 
 
187 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  37.99 
 
 
182 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.61 
 
 
187 aa  100  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  36.87 
 
 
200 aa  98.6  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.07 
 
 
188 aa  95.5  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
184 aa  95.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  36.07 
 
 
188 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.91 
 
 
185 aa  94  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.04 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.85 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.97 
 
 
187 aa  91.7  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  34.97 
 
 
187 aa  91.7  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.02 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.08 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  39.49 
 
 
190 aa  88.2  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.59 
 
 
188 aa  87.4  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.43 
 
 
186 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.09 
 
 
183 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.88 
 
 
187 aa  85.5  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4615  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.97 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.24 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.76 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.08 
 
 
187 aa  82  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  32.42 
 
 
189 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  33.88 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.18 
 
 
188 aa  79  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.72 
 
 
188 aa  77.4  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.13 
 
 
201 aa  77.4  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  35.11 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.76 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.19 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.25 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.81 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  39.16 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  27.91 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28040  dihydrofolate reductase  32.48 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.160923  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  34.59 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  37.29 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.42 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.86 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.96 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.46 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  29.83 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.81 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.74 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  32.97 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  30.22 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.02 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.55 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  39.47 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0230  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.06 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  31.38 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  34.3 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.1 
 
 
189 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.89 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  34.36 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.32 
 
 
185 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  33.1 
 
 
167 aa  62  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  30.05 
 
 
178 aa  61.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  27.17 
 
 
181 aa  61.2  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  34.29 
 
 
208 aa  60.8  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.91 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  31.02 
 
 
181 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.99 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.17 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.12 
 
 
204 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.11 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  29.84 
 
 
178 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.63 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.66 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  26.63 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.43 
 
 
199 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.29 
 
 
201 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.42 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  30.65 
 
 
180 aa  58.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  32.14 
 
 
179 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.79 
 
 
181 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  29.21 
 
 
192 aa  58.2  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.88 
 
 
187 aa  57.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  29.21 
 
 
192 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.42 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.32 
 
 
180 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.46 
 
 
190 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.9 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.87 
 
 
209 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.54 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>