198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1629 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
185 aa  383  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  92.93 
 
 
194 aa  351  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  82.07 
 
 
186 aa  320  9.000000000000001e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  75 
 
 
185 aa  298  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3672  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  81.88 
 
 
151 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  59.56 
 
 
182 aa  226  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  60.11 
 
 
182 aa  225  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  60.11 
 
 
182 aa  221  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  59.12 
 
 
200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  41.4 
 
 
188 aa  134  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.33 
 
 
183 aa  125  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  38.38 
 
 
188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.09 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.13 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.26 
 
 
180 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.24 
 
 
183 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  32.57 
 
 
177 aa  99.8  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  33.33 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  33.33 
 
 
181 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  37.5 
 
 
167 aa  95.9  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  30.29 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.65 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.95 
 
 
188 aa  92  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 
188 aa  91.7  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  34.55 
 
 
190 aa  86.3  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  32.22 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.68 
 
 
201 aa  85.1  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  38.51 
 
 
208 aa  84.3  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.72 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  31.91 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  34.92 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.03 
 
 
184 aa  82  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.83 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  35.68 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  35.62 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.84 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  39.86 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.46 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  35.16 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.26 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.58 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  29.19 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  30.11 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.65 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.89 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  29.69 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  30.98 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.18 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.32 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.05 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.86 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  33.52 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.71 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.81 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.1 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.37 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.01 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.57 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  29.57 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.03 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  34.55 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  29.57 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.12 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  30.69 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.42 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.32 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.13 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.37 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  27.37 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.87 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  31.63 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.91 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.42 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  30.91 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  27.37 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  35.58 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  34.59 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.29 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.64 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.35 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.92 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  28.04 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.94 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.59 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  32.1 
 
 
203 aa  67  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  31.29 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.96 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  29.89 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.3 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  27.51 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.54 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  31.51 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>