More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2196 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  100 
 
 
183 aa  377  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  53.85 
 
 
187 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52.75 
 
 
185 aa  201  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  50.29 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.1 
 
 
188 aa  144  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  36.76 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.96 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  36.67 
 
 
178 aa  121  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  38.33 
 
 
178 aa  121  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  37.36 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  38.46 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  37.22 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.12 
 
 
180 aa  119  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.12 
 
 
179 aa  114  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.1 
 
 
189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  35.71 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  36.87 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  37.82 
 
 
190 aa  111  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.04 
 
 
188 aa  111  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  35.16 
 
 
181 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.31 
 
 
212 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.69 
 
 
176 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.13 
 
 
192 aa  105  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.07 
 
 
178 aa  104  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  34.22 
 
 
180 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.2 
 
 
193 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 
217 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.69 
 
 
200 aa  101  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.54 
 
 
178 aa  101  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
181 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  31.9 
 
 
228 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.32 
 
 
221 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.72 
 
 
201 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  34.55 
 
 
182 aa  98.6  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.11 
 
 
204 aa  98.6  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.32 
 
 
188 aa  98.2  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  45.37 
 
 
204 aa  97.8  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.62 
 
 
188 aa  97.4  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.66 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.41 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.05 
 
 
195 aa  96.3  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  36.18 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.84 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  35.86 
 
 
221 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  32.98 
 
 
189 aa  95.5  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.53 
 
 
204 aa  95.5  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.88 
 
 
197 aa  95.5  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.15 
 
 
204 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.05 
 
 
189 aa  95.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  36.36 
 
 
215 aa  94.7  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.31 
 
 
186 aa  94.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.89 
 
 
194 aa  94.4  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.8 
 
 
188 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  32.8 
 
 
188 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.46 
 
 
188 aa  93.6  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  31.67 
 
 
177 aa  94  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35 
 
 
182 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.76 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  32.8 
 
 
188 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.32 
 
 
221 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  35.68 
 
 
205 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  34.41 
 
 
181 aa  92  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.96 
 
 
177 aa  92  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.74 
 
 
187 aa  91.7  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  32.67 
 
 
218 aa  91.7  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.45 
 
 
186 aa  91.3  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 
184 aa  90.9  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  31.66 
 
 
198 aa  89.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  31.77 
 
 
199 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.89 
 
 
201 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.97 
 
 
181 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35 
 
 
183 aa  88.2  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  40.15 
 
 
203 aa  88.2  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  35.29 
 
 
183 aa  87.8  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 
187 aa  86.3  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  34.59 
 
 
187 aa  86.3  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  28.27 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
219 aa  85.1  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.73 
 
 
182 aa  85.1  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  32.82 
 
 
219 aa  84.7  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.49 
 
 
210 aa  84.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.84 
 
 
183 aa  84.3  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.79 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
182 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.47 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.55 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.23 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.75 
 
 
192 aa  82  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.79 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  30.37 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.05 
 
 
203 aa  80.9  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.18 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  32.96 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.03 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>