266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6890 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  100 
 
 
179 aa  362  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  50.29 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.65 
 
 
187 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.09 
 
 
185 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  38.86 
 
 
181 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.76 
 
 
179 aa  123  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  43.02 
 
 
180 aa  122  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  37.71 
 
 
181 aa  120  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.95 
 
 
180 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.33 
 
 
188 aa  117  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.96 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  34.83 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.22 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  36.21 
 
 
183 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  33.93 
 
 
178 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  36 
 
 
183 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  36.05 
 
 
178 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.88 
 
 
221 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  35.59 
 
 
189 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.02 
 
 
217 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.42 
 
 
204 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
178 aa  100  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.45 
 
 
221 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  37.41 
 
 
215 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  35.68 
 
 
190 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.69 
 
 
204 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  42.45 
 
 
221 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  44.7 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  33.7 
 
 
186 aa  98.2  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  38.85 
 
 
204 aa  97.4  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.44 
 
 
189 aa  97.1  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.45 
 
 
193 aa  95.5  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.97 
 
 
188 aa  94.4  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.15 
 
 
188 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
188 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  34.3 
 
 
181 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.29 
 
 
221 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
188 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  34.24 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35 
 
 
201 aa  92.8  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.6 
 
 
209 aa  92.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.53 
 
 
177 aa  92  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.9 
 
 
197 aa  92  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.34 
 
 
178 aa  92  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3672  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  38.51 
 
 
151 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  40.74 
 
 
219 aa  91.3  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.07 
 
 
195 aa  90.5  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  40.74 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
228 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.64 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  37.2 
 
 
205 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.42 
 
 
187 aa  88.2  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  31.52 
 
 
185 aa  88.2  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.69 
 
 
200 aa  87.8  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  34.29 
 
 
198 aa  87.8  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.12 
 
 
192 aa  87.8  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  34.64 
 
 
182 aa  87.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  35.71 
 
 
177 aa  87.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.73 
 
 
188 aa  87  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.46 
 
 
217 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  38.46 
 
 
217 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  35.56 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.79 
 
 
219 aa  86.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  32.6 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.58 
 
 
190 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.52 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  32.22 
 
 
185 aa  85.9  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.89 
 
 
181 aa  85.1  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.03 
 
 
204 aa  85.1  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  37.82 
 
 
217 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.3 
 
 
178 aa  84.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.64 
 
 
183 aa  84.7  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  32.57 
 
 
184 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.71 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.46 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  38.64 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.67 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  35.62 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  29.61 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  30.34 
 
 
181 aa  80.9  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.55 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.57 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.82 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  32.5 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  35.03 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  34.64 
 
 
200 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.71 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.99 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.61 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  31.02 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.23 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.72 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.09 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  32.2 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.39 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  33.97 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>