252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0841 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  387  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.89 
 
 
186 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.77 
 
 
188 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  41.53 
 
 
199 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.44 
 
 
188 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  40.44 
 
 
188 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  40.44 
 
 
188 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.96 
 
 
190 aa  131  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  39.57 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.8 
 
 
187 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.54 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.25 
 
 
187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.97 
 
 
188 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  34.72 
 
 
196 aa  121  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  38.25 
 
 
187 aa  120  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  37.5 
 
 
181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.43 
 
 
188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  36.96 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.48 
 
 
192 aa  115  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.07 
 
 
187 aa  114  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.23 
 
 
199 aa  114  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  33.15 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.68 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.05 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.5 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  35.45 
 
 
178 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  39.04 
 
 
187 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.86 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  40.82 
 
 
182 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.43 
 
 
187 aa  105  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.79 
 
 
193 aa  104  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  35.59 
 
 
179 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.63 
 
 
194 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
180 aa  101  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  34.76 
 
 
183 aa  101  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  39.57 
 
 
190 aa  101  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  31.35 
 
 
178 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  36.36 
 
 
178 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  32.62 
 
 
183 aa  97.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.33 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  32.98 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
178 aa  95.5  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
185 aa  92  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.05 
 
 
180 aa  92  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  31.18 
 
 
181 aa  92  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.07 
 
 
176 aa  92  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.79 
 
 
183 aa  91.3  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.48 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  31.16 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.97 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.5 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.76 
 
 
186 aa  87.8  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.62 
 
 
180 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.61 
 
 
176 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.86 
 
 
191 aa  85.1  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  33.88 
 
 
176 aa  85.5  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.2 
 
 
204 aa  84.3  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  32.43 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.95 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  36.62 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  29.73 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  31.18 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.84 
 
 
184 aa  82  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
183 aa  82  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.1 
 
 
197 aa  82  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.9 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  34.27 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.68 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.69 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.65 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0230  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.7 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.86 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.85 
 
 
200 aa  79  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.53 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.75 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  32.42 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.03 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.11 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.47 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  30.81 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  31.66 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.21 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  28.09 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  33.33 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.99 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  30.41 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.1 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  30.48 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.95 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.35 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  35.21 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  29.95 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.69 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.12 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  28.64 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1085  deaminase-reductase domain-containing protein  32.64 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.655465  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.02 
 
 
189 aa  72  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  30.69 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>