279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1605 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
187 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  83.96 
 
 
187 aa  301  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  81.28 
 
 
187 aa  295  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  81.28 
 
 
187 aa  293  7e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  80.21 
 
 
187 aa  290  9e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  63.27 
 
 
196 aa  246  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  65.05 
 
 
186 aa  244  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  86.01 
 
 
182 aa  229  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  53.48 
 
 
199 aa  214  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  53.48 
 
 
188 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  53.48 
 
 
188 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  53.48 
 
 
188 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.03 
 
 
190 aa  166  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  43.55 
 
 
190 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.68 
 
 
187 aa  144  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.71 
 
 
188 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  45.21 
 
 
190 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.33 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  36.07 
 
 
189 aa  124  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.95 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.51 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.43 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.59 
 
 
183 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.89 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.13 
 
 
199 aa  114  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.83 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.87 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4615  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.89 
 
 
193 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  32.09 
 
 
185 aa  108  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  31.35 
 
 
182 aa  105  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  31.82 
 
 
177 aa  102  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.11 
 
 
181 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  34.76 
 
 
178 aa  101  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.55 
 
 
187 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.55 
 
 
185 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  35.68 
 
 
183 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.25 
 
 
176 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  38.65 
 
 
177 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.35 
 
 
183 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.7 
 
 
182 aa  98.6  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.03 
 
 
189 aa  99  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 
184 aa  97.8  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  32.61 
 
 
182 aa  97.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  34.78 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30 
 
 
181 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0230  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.04 
 
 
184 aa  95.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4799  hypothetical protein  85.19 
 
 
89 aa  95.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal  0.138579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  37.58 
 
 
176 aa  94.7  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.91 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.41 
 
 
180 aa  92.4  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.84 
 
 
178 aa  92  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  33.16 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.94 
 
 
176 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  36.08 
 
 
176 aa  89.4  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.11 
 
 
186 aa  89  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.42 
 
 
194 aa  88.2  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.36 
 
 
193 aa  88.2  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
201 aa  88.2  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  33.33 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.73 
 
 
176 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  29.41 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.18 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.39 
 
 
181 aa  85.5  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
181 aa  84.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.83 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  32.45 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.77 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.45 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28040  dihydrofolate reductase  37.23 
 
 
183 aa  82  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.160923  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  31.55 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.43 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.69 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.57 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  30.11 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  26.86 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  28.99 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.38 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.65 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.26 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  26.29 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  26.86 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  26.86 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  26.86 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  30.32 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  24.74 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  31.02 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  25.28 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  29.02 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  29.89 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.69 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.08 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  30.81 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.32 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>