More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4224 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  363  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  72.88 
 
 
181 aa  268  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  61.38 
 
 
192 aa  242  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  65.19 
 
 
183 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  53.51 
 
 
203 aa  187  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52.22 
 
 
182 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  53.3 
 
 
199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  46.37 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  49.44 
 
 
179 aa  171  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.25 
 
 
180 aa  166  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  44.13 
 
 
181 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.23 
 
 
201 aa  153  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  43.89 
 
 
183 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  43.58 
 
 
180 aa  149  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.38 
 
 
183 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  45.51 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.13 
 
 
188 aa  143  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  43.26 
 
 
178 aa  141  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  41.48 
 
 
178 aa  137  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.02 
 
 
183 aa  137  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.72 
 
 
187 aa  134  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  40.33 
 
 
178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.39 
 
 
204 aa  134  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.78 
 
 
187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.44 
 
 
181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  39.15 
 
 
204 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  36.32 
 
 
228 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.63 
 
 
186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.65 
 
 
219 aa  127  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  40.62 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.14 
 
 
204 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.08 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.66 
 
 
221 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  38.54 
 
 
221 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  38.14 
 
 
215 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  38.76 
 
 
180 aa  123  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  39.18 
 
 
219 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.34 
 
 
185 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  36.67 
 
 
183 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  40.85 
 
 
221 aa  121  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.63 
 
 
204 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.79 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.92 
 
 
188 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  35.94 
 
 
218 aa  119  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.56 
 
 
180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.08 
 
 
178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.24 
 
 
221 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.25 
 
 
187 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.46 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.23 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  36.41 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.08 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.38 
 
 
201 aa  115  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  38.54 
 
 
203 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.62 
 
 
208 aa  114  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.08 
 
 
224 aa  114  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.23 
 
 
176 aa  114  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.23 
 
 
221 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.59 
 
 
201 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.43 
 
 
178 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0509  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.98 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  41.03 
 
 
181 aa  111  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.75 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.06 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.46 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.85 
 
 
189 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.57 
 
 
197 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.64 
 
 
189 aa  108  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.43 
 
 
178 aa  107  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.22 
 
 
196 aa  106  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.53 
 
 
210 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.52 
 
 
185 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  36.13 
 
 
200 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.07 
 
 
209 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  34.08 
 
 
183 aa  105  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  38.55 
 
 
177 aa  103  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  31.69 
 
 
180 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  36.05 
 
 
179 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.76 
 
 
217 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  36.76 
 
 
217 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  34.92 
 
 
187 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  36.6 
 
 
199 aa  101  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.83 
 
 
188 aa  100  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  36.22 
 
 
217 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  34.59 
 
 
214 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.16 
 
 
188 aa  99  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  36.36 
 
 
189 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 
181 aa  98.6  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.92 
 
 
194 aa  97.8  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
188 aa  97.8  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.62 
 
 
194 aa  97.8  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.43 
 
 
192 aa  97.8  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  36.79 
 
 
205 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3213  putative secreted protein  48 
 
 
98 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.82639  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  34.38 
 
 
182 aa  96.7  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  37.35 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.23 
 
 
204 aa  95.9  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.68 
 
 
209 aa  95.9  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.21 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.62 
 
 
188 aa  95.5  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>