251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1068 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
178 aa  360  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.52 
 
 
181 aa  205  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  51.67 
 
 
180 aa  177  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  53.33 
 
 
181 aa  169  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.94 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.26 
 
 
183 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  42.76 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  38.67 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.46 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  39.89 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  36.1 
 
 
228 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.37 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  37.43 
 
 
178 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.3 
 
 
192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.75 
 
 
219 aa  108  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 
212 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  35.39 
 
 
181 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.09 
 
 
180 aa  101  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.07 
 
 
181 aa  101  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.56 
 
 
181 aa  101  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.94 
 
 
210 aa  101  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.6 
 
 
180 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.11 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.05 
 
 
201 aa  99  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  36.87 
 
 
199 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.5 
 
 
187 aa  98.6  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  35.2 
 
 
183 aa  98.2  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.22 
 
 
217 aa  98.2  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  36.79 
 
 
205 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.02 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.44 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.1 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  35.75 
 
 
198 aa  95.9  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.16 
 
 
194 aa  94.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.26 
 
 
188 aa  94.4  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.01 
 
 
196 aa  93.6  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  33.85 
 
 
208 aa  93.6  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.16 
 
 
188 aa  94  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3623  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.95 
 
 
192 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.05 
 
 
200 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  36.6 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.31 
 
 
203 aa  92.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.73 
 
 
204 aa  91.3  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  35.93 
 
 
215 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.42 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.6 
 
 
224 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.68 
 
 
188 aa  89.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  32 
 
 
178 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.44 
 
 
178 aa  88.2  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
182 aa  87.8  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.08 
 
 
209 aa  87.8  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.73 
 
 
185 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.54 
 
 
221 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  34.55 
 
 
221 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.02 
 
 
221 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  33.88 
 
 
204 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  33.87 
 
 
205 aa  85.1  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
218 aa  85.5  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.44 
 
 
221 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.17 
 
 
189 aa  84.3  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  32.81 
 
 
200 aa  84.3  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.67 
 
 
177 aa  84  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  32.79 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.41 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.19 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  29.69 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  32.98 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.96 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.97 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.11 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  29.17 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  32.81 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.86 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  35.62 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  32.6 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.74 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.85 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.97 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.97 
 
 
217 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  33.97 
 
 
217 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  33.88 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.03 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.34 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.88 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.12 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  31.18 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  29.89 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  35.8 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.48 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.65 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  26.84 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  31.64 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.47 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>