219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0285 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
188 aa  371  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.02 
 
 
189 aa  135  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.62 
 
 
191 aa  114  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.83 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.88 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.8 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.92 
 
 
212 aa  89  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.57 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  35.57 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  35.2 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.02 
 
 
187 aa  87  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.64 
 
 
177 aa  84.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.41 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  31.91 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  34.55 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  35.38 
 
 
199 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  36.3 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.7 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.88 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  36 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  29.41 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.12 
 
 
204 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  35.03 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  31.52 
 
 
204 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  30.77 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3984  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.35 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.34 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  38.18 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  35 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.61 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.78 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.08 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.73 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.04 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  31.91 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  34.86 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.26 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.13 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.16 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.34 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  37.04 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.57 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.63 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.78 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.04 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.5 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3672  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  38.51 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  33.51 
 
 
182 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.18 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
186 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.28 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  31.96 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.98 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.14 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  36.36 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.37 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.13 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.96 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.69 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5731  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.63 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  34.01 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  37.59 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  33.57 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.19 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  35.67 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.95 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  32.21 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.41 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  28.57 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  35.51 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.32 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.45 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.67 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.12 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.8 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.45 
 
 
210 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  37.21 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.34 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.53 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.88 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.63 
 
 
221 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  28.24 
 
 
199 aa  62.8  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  34.81 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.17 
 
 
177 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  33.56 
 
 
203 aa  62  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  31.91 
 
 
181 aa  62  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  31.66 
 
 
192 aa  62  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  28.34 
 
 
178 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.34 
 
 
219 aa  61.6  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.61 
 
 
194 aa  61.6  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.66 
 
 
186 aa  61.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>