192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3984 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3984  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5731  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  48 
 
 
201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1085  deaminase-reductase domain-containing protein  38.92 
 
 
197 aa  132  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.655465  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2085  deaminase-reductase domain-containing protein  34.31 
 
 
242 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.242441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.16 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.5 
 
 
178 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.68 
 
 
188 aa  89.4  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.25 
 
 
194 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.47 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.35 
 
 
188 aa  82  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.98 
 
 
177 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.78 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.05 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  33.82 
 
 
190 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  35.71 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.32 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.5 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  32.39 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.99 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  33.86 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.54 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  31.84 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.5 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.54 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.68 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.11 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.98 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.5 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.67 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  35.5 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  31.34 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.09 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.15 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.81 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  32.54 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.35 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.61 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.18 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.39 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  28.02 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  32.07 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  28.78 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.58 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  31.84 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.66 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  30.1 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.24 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.85 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.85 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.32 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  24.77 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  30.1 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  32 
 
 
184 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.98 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.51 
 
 
186 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.36 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  31.55 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.8 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.7 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  35.17 
 
 
183 aa  62.8  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.01 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.08 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  30.81 
 
 
213 aa  62.4  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  34.46 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  25.12 
 
 
181 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.44 
 
 
187 aa  62  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
187 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.75 
 
 
183 aa  61.6  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.99 
 
 
204 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  30.73 
 
 
192 aa  61.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  31.31 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  29.15 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  28.29 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.69 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.71 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  30.49 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.45 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  30.35 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.82 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.1 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.8 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  27.8 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29 
 
 
219 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.84 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.68 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  31.19 
 
 
221 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  31.66 
 
 
204 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32 
 
 
186 aa  58.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.36 
 
 
185 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.23 
 
 
189 aa  58.2  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  27.27 
 
 
176 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  30.43 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  30.65 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.48 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>